Из семян картинки: ⬇ Скачать картинки D1 81 d0 b5 d0 bc d0 b5 d0 bd d0 b0, стоковые фото D1 81 d0 b5 d0 bc d0 b5 d0 bd d0 b0 в хорошем качестве
Клубника из семян фото
Главная » Клубника » Клубника из семян фото
Посадка клубники семенами
Многие садоводы даже не задумываются о возможности получения рассады клубники из семян. Действительно, садовая земляника – это растение, которое само и с завидным упорством заботится о посадочном материале. Дачнику остается следить, чтобы молодые растения не слишком теснили плодоносящие материнские кусты, отделять дочерние розетки и формировать на участке новые посадки клубники или земляники.Но такое традиционное представление теряет актуальность, поскольку все чаще появляются безусые сорта, размножающиеся лишь делением куста или семенами. Примером тому могут служить ремонтантные сорта. И если у знакомых или соседей по даче понравившегося растения нет, то неизбежна посадка клубники семенами и связанные с ней хлопоты и успехи.
Выбор материала для посева
Первая задача, стоящая перед дачником, это подбор посевного материала.- С помощью предлагаемых компаниями-производителями семян можно получить растения самых новых и урожайных сортов или гибридов, как крупноплодной клубники, так и ремонтантной земляники.
- Если же для посадки клубники семенами на рассаду используется собственный материал, то дачнику важно знать о двух моментах. Сбор семян ведут только с сортовых растений, поскольку гибриды не передают потомству свои качества. Семена собственного сбора обычно обладают лучшей всхожестью и выносливостью, чем купленные.
Время сева для посадки клубники весной
Чтобы при пересадке на постоянное место молодые розетки попали еще весной, высевать клубнику нужно в феврале, марте или даже раньше, если посадкам клубники будет обеспечена дополнительная подсветка. Семена, попавшие в землю в мае или июне, дадут саженцы, которые можно использовать для зимнего получения ягоды в теплице. В противном случае рассаде придется зимовать в контейнерах или горшках.
Предварительное проращивание для посадки клубники семенами
Семена клубники, будь то крупноплодное растение или альпийская земляника, всходят долго и этим часто доставляют беспокойство садоводу. Ускорить процесс можно, предварительно замочив посевной материал на 2–3 суток в мягкой талой воде.
- Чтобы мелкие семена не были потеряны, их лучше разложить на ватном диске или фильтровальной бумаге, а затем поместить в неглубокую емкость с водой.
- С набухших семян сливают излишки влаги, емкость накрывают пленкой, стеклом или пластиком и ставят в теплое место. Уже в это время для посевов важно достаточное освещение. До тех пор пока не станут заметны ростки, под пленку добавляют воду, не допуская высыхания или развития плесени.
Подготовка грунта для посадки семян клубники на рассаду
Грунт для клубники должен быть достаточно рыхлым и питательным. В состав почвенной смеси включают:
- одну часть качественного, очищенного от грубых включений торфа;
- две части дерновой земли;
- одну часть чистого речного песка.
В грунт добавляют комплекс минеральных удобрений или просеянную золу с перепревшим навозом.
Чтобы исключить заражение сеянцев какой-либо инфекцией или поражение вредителями, оставшимися в почве, до посадки клубники семенами грунт полчаса пропаривают и дают три недели выстояться.
Посев клубники
Вариантов посева семян клубники несколько, но главное правило только одно. Нельзя допустить заглубления мелких семян в почву и из размыва при поливе.
- В уплотненной и разровненной почве делают неглубокие бороздки, куда на расстоянии 2 см одно от другого раскладывают семена. Заделку не производят, а для обильного, но аккуратного полива использую пульверизатор.
- Поскольку посадка семян клубники на рассаду ведется зимой, то часто для посева используют снег. Его разравнивают на грунте слоем до 1 см, а поверх раскладывают семена. По мере таяния семена ложатся на почву, а грунт увлажняется.
- Для посева используют и торфяные таблетки, причем для клубники подойдут самые мелкие.
Стратификация посеянных семян помогает быстрее дождаться дружных всходов клубники. Для этого емкости с содержащим семена влажным грунтом ставят на холод, где при температуре от 0 до +4 градусов посевы пробудут около недели. Затем контейнеры извлекают, накрывают стеклом или пленкой и ставят на свет для проращивания.
Уход за сеянцами клубники
- Как только над грунтом появляются ростки, растениям нужно обеспечить дополнительную подсветку. Это особенно важно, если посадка клубники семенами на рассаду проходила в зимние месяцы.
- Пленку постепенно, начиная с часа в сутки, начинают снимать, когда появятся первые настоящие листья.
- А до этого момента следят, чтобы на почве не развивались плесневые грибы – признак переувлажнения и затхлости. Поливать рассаду лучше в поддон.
- Если для посадки клубники семенами использовались общие контейнеры, то ростки дважды или трижды пикируют, в результате рассаживая по отдельным емкостям.
- Для лучшей акклиматизации молодые растения закаливают, вынося в дневные часы на открытый воздух, предварительно оградив посадки от ветра и прямых лучей солнца. В мае срок пребывания на улице увеличивают, оставляя готовую к высадке рассаду при температуре не ниже +5 градусов и на ночь.
Посадка клубники в грунт
В открытый грунт рассада клубники высаживается в конце мая или июне, когда минует опасность заморозка. В теплицы и пленочные парники посадка клубники весной может проводиться гораздо раньше.
При благоприятном стечении обстоятельств наиболее сильные растения могут дать первый урожай уже в текущем сезоне. Но опытные дачники все же советуют в первое лето удалять цветоносы, чтобы розетка набрала силу к зимовке и плодоношению в следующем году.Если к началу лета рассада оказалась не готова к пересадке в грунт, не стоит отчаиваться. Попав на грядки до конца августа, она успеет прижиться. Даже подросшие осенью розетки можно сохранить до весны в условиях погреба или, прикопав в контейнерах на дачном участке и хорошо прикрыв лапником, дубовой листвой или другим утеплителем.
Посадка семян клубники в торфяные таблетки — видео
glav-dacha.ru
Выращивание земляники из семян в торфяных таблетках
Семена крупноплодных гибридов земляники стоят дорого. К тому же в упаковке содержится от 3 до 10 мелких семечек. Их легко потерять в посевных ящиках и плошках, поэтому лучше сеять семена такой земляники в торфяные таблетки. Способ удобен и тем, что на первом этапе не нужно просеивать и пропаривать почвенную смесь и пикировать сеянцы земляники.
Земляника — сеять семенами или нет?
Не думайте, что выращивание земляники из семян — дело ненадёжное и весьма трудоемкое. Это полезно и увлекательно!
Во-первых, за один сезон можно получить достаточно много кустиков нового сорта. Тем более, что большинство сортов альпийской (мелкоплодной) земляники не дает усов, но через 3-4 года требует омоложения.
Во-вторых, таким образом можно получить землянику новых сортов. А их сейчас в продаже появилось большое количество, в том числе и крупноплодные ремонтантные сорта.Крупноплодную садовую землянику — «клубнику» — и мелкоплодную альпийскую землянику сеют одинаково.
Сроки посева земляники на рассаду
В домашних условиях землянику высевают на рассаду в конце февраля-начале марта. В более ранние сроки землянику сеют в питомниках, когда нужно уже в начале сезона выставить готовую рассаду на продажу. Если такой цели нет, торопиться не стоит. При отсутствии дополнительной подсветки приступайте к посеву в первой декаде марта.
Подготовка семян земляники к посеву — замачивание и стратификация
Разложите семена земляники между двумя ватными дисками или кусочками чистой ткани, сложенной в 2-3 слоя. Поместите их в контейнер для микроволновки или в другую посуду, увлажните, закройте крышкой, предварительно проделав в ней несколько отверстий для проветривания. Если у вас несколько сортов, снабдите их этикетками. Подержите их 2-3 дня при температуре +15…+18°С, затем уберите замоченные семена земляники в холодильник на 2 недели.
Некоторые садоводы советуют помещать в холодильник готовые посевы. Но стратифицировать в контейнере гораздо удобнее: он занимает меньше места. Через 2 недели поставьте контейнер в тёплое (+18…+20°С) светлое место. Проверяйте семена раз в 2-3 дня, чтобы не пропустить момент прорастания.
Когда семена земляники проклюнутся, наступает время посева. Положите торфяные таблетки в контейнер, залейте их водой. Подождите, пока из таблеток они не превратятся в «столбики». Подливайте воду до тех пор, пока она не перестанет впитываться таблетками. Излишки слейте.
Разложите «наклёвыши» в углубления в таблетках. Очень удобно это делать зубочисткой. Засыпать семена землёй не нужно: земляника лучше всходит на свету. Семена присыпают только при посеве летом в саду, чтобы они не погибли от пересушивания.
Важно, чтобы проклюнувшиеся семена не подсыхали. Для этого накройте контейнер прозрачной крышкой или поместите его в тепличку. Поставьте посевы земляники в светлое место с температурой не выше +20°С.
Ежедневно убирайте конденсат с крышки, проветривайте, чтобы не образовалась плесень. Если вы всё же заметили первые признаки плесени, осторожно уберите её зубочисткой и капните на это место раствором препарата Максим или другим фунгицидом.
После появления первых настоящих листочков укрытие можно снять. Корешки земляники (если они оголены) присыпьте до корневой шейки небольшим количеством земли. Если заметите, что торфяные «столбики» оседают, добавьте в контейнер воду до полного впитывания, а излишки слейте.
Чем подкармливать землянику
Раз в 2 недели долив воды совмещайте с подкормкой. Рассаду земляники лучше подкармливать гуматами или раствором минеральных удобрений для рассады.
Если погода позволяет, с конца апреля-начала марта можно приступать к закаливанию на балконе или застеклённой веранде. Первое время прикрывайте рассаду от прямых солнечных лучей и ветра. Кратковременное ночное понижение температуры до +3. ..+5°С даже полезно.
Посадка земляники в грунт
Высаживать рассаду в грунт можно после 10 июня. У хорошо развитой рассады корни видны на поверхности торфяной таблетки.
Учитывая, что ремонтантные сорта земляники плодоносят весь сезон, почва для неё должна быть рыхлая, плодородная. Желательно внести перегной или хорошо перепревший компост. Его количество зависит от исходного состояния грядки. Если это окультуренная садовая земля, достаточно по 0,5 ведра перегноя и торфа на 1 кв.м. Если земля глинистая, удвойте количество перегноя и торфа и добавьте 0,5 ведра песка. Норма внесения полного минерального удобрения-30-40 грамм на 1 кв.м. Тщательно перекопайте на штык лопаты и разровняйте так, чтобы не было уклона.
Чтобы ряды получились ровные, натяните на грядке посадочный шнур. Обозначьте ряд неглубокой бороздкой.
Сделайте лунки на расстоянии 30 см. Установите торфяные таблетки с рассадой.
Аккуратно заполните оставшееся в лунке пространство рыхлой землёй так, чтобы точка роста земляники (сердечко) находилось на уровне поверхности земли. Уплотните.
Осторожно, чтобы не размыть землю вокруг кустика, полейте рассаду земляники.
И ещё один совет: выращивать мелкоплодную землянику удобно на узких грядках не более, чем в 2 ряда. Расстояние между рядами 35-40 сантиметров. Можно выращивать в 1 ряд по краю других культур или плодовых кустарников, отступая от них на 50-60 см.
Большее количество рядов затрудняет регулярный сбор ягод и обработку растений после очередной волны плодоношения.
Перейти к основной статье о клубнике (садовой землянике)
Кстати
Высотная обрезка: секаторы и сучкорезы WOLF-Garten
Время от времени кусты и деревья в саду требуют омолаживающей обрезки. Высотные секаторы и сучкорезы, которые мы предлагаем, помогут вам преобразить свой сад. Сверхлегкие рукоятки (в том числе и телескопические) обеспечат возможность высотной обрезки растений на выстоте до 5,5 метров. В сочетании с прекрасной эргономикой оптимизированная система повышения момента силы упрощает и облегчает работу с инструментом. «Сделано в Германии» — это всеми признанный знак качества Функциональность, хорошая эргономика и высокое качество материалов — это главные характеристики инструментов WOLF-Garten. Это не просто громкие заявления — мы предоставляем 10-летнюю гарантию на все немоторизованные инструменты для обрезки (исключая пластиковые сменные детали).
supersadovnik.ru
Как вырастить крупную и сладкую клубнику из семян
Заготовка семян клубники своими руками
Множество семян клубники различных сортов можно купить в магазине. На упаковках даже написано, как именно выращивать их. Но многие садоводы стремятся сами получить семена для размножения понравившегося сорта.
Для этого выбираем самую крупную и здоровую спелую ягоду, срезаем с неё верхний слой с семенами («шкурку»), лучше брать семена с середины ягоды и с верхней части (у стебелька). Там они будут более крупные и зрелые.
Срезанный слой разложим на ткани, можно на кусочке туалетной бумаги или салфетке. Делаем это для того, чтобы ягодный сок мог впитаться в неё. Далее ждём – мякоть должна высохнуть. Когда это произойдёт, аккуратно разотрём её в ладонях и отделим семечки. Хранить эти семена можно до 4 лет. Поместим их на хранение в стеклянную баночку.
Сделать это не сложно, и время будет потрачено не зря, а для получения качественной рассады любимого сорта, чтобы в будущем вас радовали плоды вашего труда.
Посев семян клубники
Обычно семена рекомендуют высевать в январе или феврале (в крайнем случае, в марте). Готовим для этого почвосмесь. Она состоит из 5 частей рыхлого перегноя, перемешанного с 3 частями песка. Перед посевом семян (за 2-3 недели) землю нужно прожарить в духовом шкафу, чтобы уничтожить все вредные споры и микроорганизмы. За это время (от прожарки до посева) в земле восстановятся необходимые микробиологические свойства.
- Берём ящик для рассады
- На дно насыпаем керамзит или щебень слоем около 2 см
- Сверху досыпаем грунтом до 13-15 см, уплотняем
- Делаем в грунте узенькие канавки до 0,5 см глубиной
- Немного польём их водой
- Аккуратно посеем семена, присыпав их сверху небольшим слоем грунта или торфа.
- Сверху ящик накроем плёнкой или целлофановым пакетом – так меньше будет испаряться влага.
- После этого ящик поместим в холодное место (температура от 0 до +5°С) на 4-5 дней.
- Почва с семенами всегда должна быть влажной, но не мокрой. Необходимо следить, чтобы она не пересохла. Семена клубники обычно туго всходят, т.е. долго. Чаще это происходит через 23-25 дней.
- После охлаждения ящик с семенами необходимо держать в тёплом месте – около 22°С.
Пикировка и высадка рассады клубники
И вот мы дождались всходов. Когда первые нежные ростки клубнички выпустят пару настоящих листочков, мы их пересадим (пикируем) в отдельные горшочки, можно в торфяные стаканчики или в другой ящик. Высадим их на расстоянии 2-3 сантиметра один от другого. Опять же не забудем их полить после пересадки. После этого поместим горшочки с рассадой в прохладное место с температурой от 14 до 16°С.
Днём в тёплую погоду рассаду необходимо ненадолго выносить на неяркое солнце. Лучше это делать по утрам, когда лучи ещё не жгут. Так мы приучим её к пребыванию на солнце.
Когда на улице станет совсем тепло, т.е. в конце мая, на наших клубничках уже должно быть не меньше 5 листиков. Тогда мы вынесем нашу рассаду на участок и рассадим её уже на постоянное «место жительства». На грядке рассаду высаживаем через каждые 15 см ровными рядками, между которыми останется промежуток около 25 см.
При высадке рассады клубники нельзя забывать, что её корни полностью должны быть в земле, а точку роста (место, откуда растут листья) засыпать нельзя. Если корни окажутся на поверхности, то они могут засохнуть. А, если они будут глубоко в земле, то кустик клубники начнёт болеть, может загнить – в любом случае, урожая хорошего тогда не ждите.
Дальнейший уход за высаженной рассадой ничем не отличается от ухода за клубникой, разведённой усами.
grounde.ru
Как правильно сажать семена клубники, фото
Размножаться семенами может любой сорт клубники, кроме так называемых гибридов. К тому же семена не портятся от длительного хранения и не являются носителями вирусов, вредящих растению. А сорта клубники можно специально подобрать по периодам созревания, чтобы получать ягоды на протяжении весны, лета и осени, ведь ее посадка возможна уже с конца января – начала февраля.
Обычно для посадки семена приобретаются в готовом виде, но чтобы быть уверенным в получении нужного сорта их можно заготовить собственноручно.
Работа с семенами и сортировка всходов
До того, как поместить семена в почву, ее необходимо подготовить: пропорционально смешать торф, перегной, дерновую землю и песок. Полученный состав увлажняется и расфасовывается в пластиковые (одноразовые) стаканы так, чтобы заполнить их не до самого верха, а немногого ниже края.
Вместо стаканов можно использовать любую подходящую емкость большого размера, но тогда после появления побегов их все равно придется пересадить в отдельные горшочки. Каждое семя помещается сверху грунта, который предварительно был уплотнен, но не утапливается в него.
Посев клубники закрывается пленкой, после чего его нужно поставить на два-три дня в прохладное место с температурой воздуха не более 7 градусов, это может быть и нижняя полка холодильника. Когда семена настоятся, их необходимо перенести в теплое помещение, поставив в тени. Пока семена прорастают, почву следует регулярно увлажнять.
Примерно через три недели появятся первые всходы, значит, пора их ставить на подоконник, ближе к лучам солнца.
Клубника семенами, из которой появился куст с пятью и более листьями считается подходящим для посадки на участке, если листьев меньше, то говорят, что получилась слабая рассада. Чаще так бывает при высеве семян в марте или апреле, поэтому его нужно начинать уже с середины января.
Подготовка грунта для рассады
Если после оттепели еще долгое время на участке стоит талая вода, то нужно соорудить гряды шириной 80 см и высотой около 35 см, так можно уберечь клубнику от переизбытка влаги, в том числе и в летний период, когда пройдет сильный дождь.
С целью подготовки грунта к посадке растений в него на небольшую глубину (до 20 см) засыпается перегной, калий и суперфосфат. Пропорции соответствуют 10 кг/100 г/80 г на 1 кв. м. обязательно искоренить сорняк, иначе он будет сушить корень клубники. Когда гряды подготовлены, место посадки выравнивается граблями.
Особенности посадки рассады из семян клубники
К концу мая на грунт высаживается рассада, полученная из клубники семенами. Из каждого стаканчика аккуратно извлекается побег, чтобы остались целыми корни, иначе он не приживется. На грядках растения высаживаются рядами на расстоянии 30 см друг от друга.
Засыпая куст землей, его сердцевина должна оставаться открытой. По окончанию посадки грядки заливаются водой, удобряются перегноем и притеняются пленочным материалом, а потом регулярно пропалываются.
Спустя месяц рассаду желательно подкормить пометом, разведенным водой 1:20, одного ведра хватит на 3 кв. м. С конца августа рассаду готовят к зимовке, для этого снова ее удобряют, а в первых числах октября удаляют цветоносы, на которых ягоды все равно не успеют созреть. Корни тоже нужно оградить от морозов, обложив их листьями и подсыпав перегноя в конце ноября.
proklubniku.com
Пошаговая инструкция выращивания земляники из семян
http://www.udec.ru/semena/zemlyanika.php1. Для начала выбираем семена клубники. Сейчас продается много ремонтантных и безусых сортов. Это означает, что вы будете избавлены от необходимости постоянно стричь усы, которые ослабляют растение, и ягоды на столе будут весь сезон — с июня и до снега.
2. Сеять землянику можно и в марте-апреле, но если хочется увидеть плоды в первый год — обманите природу — посейте в первой декаде февраля.
3. Почва нужна не тяжелая, не очень плодородная. Можно обычный огородный грунт смешать с песком.
4. Для посева очень удобно использовать прозрачный пластиковый контейнер. Прокалываем в дне дырочки. Если контейнер без крышки — готовим пленку и денежную резинку.
5. Контейнер заполняем рыхлой землей, оставляя 2-2,5 см. до края. Сухую почву не поливаем, а чуть увлажняем каплями с пальцев. Контейнер встряхиваем. Поверхность почвы должна получиться не утрамбованной, а просто ровной, чтобы семена не проваливались глубоко.
6. Дальнейший уход за посевом семян земляники сводится к правильному распределению семечек по поверхности грунта — слой равномерный и не обильный. Засыпать землей не нужно! Укрываем семена снегом, заполняя контейнер доверху (те самые 2-2,5 см.).
7. Закрываем контейнер крышкой или пленкой и ставим в холодильник. Полку выберите сами — снег должен растаять постепенно. В холодильнике контейнер простоит 2 недели. То, что мы с вами сделали, называют стратификацией.
8. После «зимовки» выставляем контейнер с семенами клубники на холодный подоконник. Пленку или крышку не снимаем. Если мало света — используем искусственное освещение. Поливать все еще не нужно, разве что чуть побрызгать при сильном высыхании почвы (хотя в норме растаявшего снега как раз хватает для самополива). Всходы могут появиться через 10-15 дней, некоторые сорта всходят 3-4 недели.
9. После появления всходов в пленке начинаем прокалывать дырочки — постепенно приучаем рассаду к большому миру. Пока дырочек немного, хватает самополива. Следим за почвой, она не должна пересыхать, но и избыток влаги «детей» убьет. Именно поэтому прозрачный контейнер удобнее — можно наблюдать за влажностью. И пленка или крышка тоже подскажет: если она сухая — влаги мало, срочно поливаем (каплями по стеночке или пульверизатором), если конденсата столько, что растений не видно — влаги слишком много. Тогда ненадолго открываем контейнер — проветриваем. Для полива лучше всего подходит талая вода, т.к. рассада земляники плохо реагирует на избыток солей.
11. Пикируем при появлении 2-3 настоящих листьев. Следим, чтобы не загнулся вверх корешок. Сначала сажаем на ту же глубину, затем аккуратно подсыпаем до семядольных листиков. Хорошо поливаем, чтобы почва «прилипла» к корням.
Самое страшное позади. До высадки в грунт осталось не злоупотребить с поливом или наоборот — не засушить. Не торопитесь удобрять, это позже.
Серия сообщений «ВОПРОСЫ И ОТВЕТЫ, ОБМЕН ОПЫТОМ, ЛИКБЕЗ»:Часть 1 — Массовое проращивание черенков. МК
Часть 2 — Чем различаются луковица, клубень, клубнелуковица и корневище?
…
Часть 36 — Многолетние или однолетние? Декоративные злаки
Часть 37 — Куб для огурцов
Часть 38 — Пошаговая инструкция выращивания земляники из семян
Читайте также:
- Фото клубники на грядке
- Фото ремонтантная клубника сорта
- Сорта клубники ремонтантной с фото
- Посадка клубники делением куста
- Рассада земляники из семян
- Как ухаживать за ремонтантной клубникой
- Выращивания клубники в теплице
- Клубника в теплицах
- Клубника ремонтантная теплице
- Урожайность клубники в теплице
- Сорта многоразовой клубники
- Усы ремонтантной клубники
- Уход за ремонтантной клубникой
- Уход за клубникой в теплице
- Тепличные сорта клубники
- Подготовка клубники
10 многолетников из семян, которые зацветут уже в первый год.
Фото — БотаничкаХотя большинство многолетников при выращивании из семян в первый год развиваются очень медленно, существует и особая группа многолетних цветов. Они способны к более быстрому росту и при посеве в феврале-марте раньше достигают декоративности — дарят цветы уже в первый сезон. Правда, в год посева експресс-многолетники будут иметь кусты меньшего размера и произведут меньше цветов. Махровые сорта могут продемонстрировать простые цветки с одним рядом лепестков, а сами цветочки, скорее всего, будут меньшего размера. Тем не менее такими многолетниками можно будет полюбоваться уже в этом году. Ранний посев в помещении каких многолетних цветов приведет к тому, что они зацветут уже в первый сезон? Расскажу в своей статье.
10 многолетников из семян, которые зацветут уже в первый год1. Кореопсис крупноцветковый
Кореопсис крупноцветковый (Coreopsis grandiflora) — простое в выращивании растение, образует аккуратный компактный куст и дает крупные цветки золотисто-желтого цвета. Зацветает кореопсис обычно в начала лета. Цветы хорошо смотрятся в цветник и букетах, а также привлекают в сад бабочек.
Кореопсис крупноцветковый (Coreopsis grandiflora). © Doug Waylett
Культура может расти на полном солнце. Отдельные растения часто недолговечны, но кореопсис возобновляется самосевом. Этот вид полностью зимостоек в зоне 4. Существуют современные сорта с более низкими стеблями, а также разновидности с бордовым центром на фоне желтых лепестков.
2. Гвоздика травянка
Гвоздика травянка (Dianthus deltoides) прекрасно смотрится в альпинариях, а также на переднем плане цветников. Она образует низкорослый коврик из листвы, над которой с конца весны начинают возвышаться трогательные цветки. В мягком климате листва вечнозеленая круглый год. Цветки могут быть однотонными (обычно белые или розовые) или иметь контрастные «глазки».
Гвоздика травянка (Dianthus deltoides). © Людмила СветлицкаяГвоздику-травянку сажают на полном солнце, она предпочитает нейтральную или слабощелочную почву с хорошим дренажом. Подстригите растения после цветения или дайте им возможность произвести самосев. Морозостойка для зоны 3.
3. Котовник жилковатый
Котовник жилковатый (Nepeta nervosa) — кустистое растение с ароматной листвой, цветущее в течение длительного сезона. Котовник достигает 40 см в высоту. Это относительно легкие в выращивании цветы, а его соцветия привлекают в сад опылителей. Котовник жилковатый менее привлекателен для кошек (и с меньшей вероятностью будет ими уничтожен), чем его родственник, котовник кошачий (Nepeta cataria).
Котовник жилковатый (Nepeta nervosa). © Людмила СветлицкаяЧитайте также нашу статью Котовник кошачий — польза, применение и отличия от мелиссы.
Будет хорошо расти на полном солнце и хорошо дренированных почвах, довольно засухоустойчив после посадки. Создает идеальный почвенный покров в сухих, неплодородных местах, где мало что сможет расти. Вынослив в зоне 4. Обычно цветет сине-фиолетовыми цветками, а сорт Pink Cat отличают розовые соцветия.
4. Рудбекия
Не все рудбекии (Rudbeckia) являются многолетними, а многие из многолетних разновидностей — гибриды и не передадут свои признаки при выращивании из собранных семян. Но существует несколько старых сортов с открытым опылением, которые стоит попробовать выращивать в саду.
Рудбекия (Rudbeckia). © Людмила СветлицкаяРудбекию можно высевать в помещении примерно за 6-8 недель до последних ожидаемых заморозков. Многолетние сорта лучше всего всходят, если их стратифицировать после посева. Вы можете сделать это, подержав емкости в холодильнике в течение 4 недель после посева семян. Затем переместите их обратно в теплое место, пока семена не прорастут. Рудбекию также можно высевать прямо в сад, но в этом случае она не успеет зацвести в этом же году.
5. Гелиопсис
Гелиопсис (Heliopsis) — это многолетнее растение, которое вырастает до 60-90 см в высоту и цветет яркими золотисто-желтыми, похожими на подсолнечник цветами. Цветение начинается в середине лета и продолжается до осени. Растение привлекает бабочек, идеально подходит для срезки.
Гелиопсис (Heliopsis). © Людмила СветлицкаяГелиопсис очень легко приспосабливается к различным условиям произрастания. Растение предпочитает полное солнце и переносит сухую почву после укоренения. Подходит для выращивания в зоне морозостойкости 4 и выше. Сорта могут иметь махровые цветки. Листва бывает окрашена в красный цвет или иметь золотистые прожилки.
6. Гайлардия
Гайлардия (Gaillardia) образует плотные кочки из серо-зеленой листвы, увенчанные крупными, похожими на ромашки цветками оттенков желтого, оранжевого и красного. Цветы привлекательны для бабочек и прекрасны в букетах.
Гайлардия (Gaillardia x grandiflora). © Людмила СветлицкаяГайлардия будет расти на полном солнце и в хорошо дренированной почве; переносит засуху после укоренения. Растения несколько недолговечны, но могут давать самосев. Зимостойка с зоны 3. Существуют однотонные сорта, в противовес пестро окрашенным, а также есть махровые гибриды.
7. Лихнис корончатый
Лихнис корончатый, или горицвет кожистый (Lychnis coronaria) — растение с бархатистой серебристо-серой листвой и белыми, розовыми или пурпурными цветками. Это очень кустистое растение высотой 40-90 см. Является фаворитом в палисадниках. Хотя отдельные растения живут относительно недолго, они легко дают самосев, образуя постоянные насаждения. Цветение начинается с середины лета.
Лихнис корончатый, или горицвет кожистый (Lychnis coronaria). © StefanoПосадите семена в помещении приблизительно за восемь недель до последних весенних заморозков, семена могут прорастать до месяца. Культура хорошо растет на полном солнце (возможно с небольшим притенением), в хорошо дренированной почве, предпочитает нейтральную или слабощелочную почву. Зона 4.
Читайте также нашу статью Как правильно ухаживать за лихнисом?
8.
МонардаЦветки монарды (Monarda) очаровательны и оригинальны. Дополнительная ценность — листва с ароматом солодки. Кроме того, монарда славится своим магнетизмом для опылителей. Если поселить этот цветок в своем саду, то можно все лето наблюдать как бабочки, пчелы и другие опылители слетаются на ее трубчатые цветки.
Монарда (Monarda). © Людмила СветлицкаяДля раннего цветения монарду высевают в феврале-марте. Свет ускорят прорастание. Семена всходят за одну-две недели. Монарда не всегда зацветает в год посева. Однако уже в первый сезон она станет полноправным членом цветника. Сеянцы монарды развиваются очень быстро, и она за короткое время наращивает крупные кусты. Даже если не зацветет в первый год, к осени монарда украсит сад пурпурными оттенками листвы.
9. Шалфей дубравный
Шалфей дубравный (Salvia nemorosa) — неприхотливый многолетник, который будет цвести с июня до осени, сменяя одну волну цветения за другой. Образует колосовидные соцветия, состоящие из множества цветков, обычно они фиолетового цвета, но встречаются голубые, белые и розовые сорта. Высота также зависит от сорта и можно подобрать как карликовые (до 25 см), так и высокорослые (40-60 см). Шалфей очень привлекателен для бабочек и других опылителей. Листва имеет характерный аромат.
Шалфей дубравный (Salvia nemorosa). © Людмила СветлицкаяШалфей будет расти практически на любой почве на солнечном месте. В полутени высокорослые сорта могут начать заваливаться. Обрезка отцветших соцветий будет способствовать появлению более обильной новой волны цветения, однако на какое-то время после обрезки кустики потеряют декоративность.
Семена шалфея на рассаду сеют в начале-середине марта. Свет не влияет на прорастание семян. Стратификация не требуется. Всходы появляются примерно через неделю.
Читайте также нашу статью Любите лаванду? Посадите шалфей!
10. Вероника колосковая
Прекрасные голубые цветы вероники колосковой (Veronica spicata) легко вырастить из семян, и они будут радовать все лето. Вероника имеет низкий, компактный, плотный габитус, что делает ее подходящей для выращивания в качестве почвопокровного растения. Цветки вероники формируются на колосовидном соцветии, обычно они фиолетово-синие, но бывают белыми или пурпурными. Очень привлекательны для пчел и бабочек. Основная проблема, которая может возникнуть при выращивании — грибные поражения листвы.
Вероника колосковая (Veronica spicata). © Людмила СветлицкаяВероника — выносливое многолетнее растение, она растет на солнце и хорошо переносит полутень. Не слишком требовательна к почве, но ей нужен хороший дренаж. Растению требуется умеренное количество воды. Она лучше всего цветет, когда увядшие цветочные головки регулярно обрезают.
Посейте семена вероники в помещении за 4-6 недель до последних весенних заморозков в небольшие контейнеры или стартовые лотки, используя качественную стартовую смесь для семян. Вдавите семена вероники в субстрат, но не накрывайте — свет способствует прорастанию.
посадка и уход в открытом грунте, выращивание из семян, фото
Автор: Елена Н. https://floristics.info/ru/index.php?option=com_contact&view=contact&id=19 Категория: Садовые растения Опубликовано: Последние правки:
Содержание
- Посадка и уход за статицей
- Ботаническое описание
- Выращивание статицы из семян
- Посев на рассаду
- Уход за рассадой
- Посадка статицы в открытый грунт
- Когда сажать
- Как посадить
- Уход за статицей
- Условия выращивания в саду
- Вредители и болезни
- Статица после цветения
- Виды и сорта
- Статица Суворова (Limonium suworowii)
- Статица Гмелина (Limonium gmelinii)
- Кермек широколистный (Limonium latifolium)
- Кермек Переса (Limonium perezii)
- Кермек Бондуэлли (Limonium bonduellii)
- Кермек китайский (Limonium sinensis)
- Кермек выемчатый (Limonium sinuatum)
- Литература
- Полезные ссылки
- Комментарии
Статица (статице), или кермек (лат. Limonium) – род семейства Свинчатковые, который ранее относили к семейству Кермековые. По разным источникам в роду насчитывается от 166 до 350 видов, произрастающих по всей Евразии и на других континентах, иногда образуя заросли до полуметра высотой даже в песчаных дюнах. Научное название растения означает «стойкий, непреклонный».
У нас статицу иначе называют тюркским словом «кермек», татарским белым лимонником, морской лавандой или бессмертником. В культуре это садовое растение с 1600 года.
Посадка и уход за статицей
- Цветение: с июля до заморозков.
- Посадка: посев семян на рассаду – в конце февраля или в начале марта, высадка сеянцев в открытый грунт – в конце мая или в начале июня.
- Освещение: яркий солнечный свет.
- Почва: дренированная, супесчаная или суглинистая, слабощелочной или нейтральной реакции.
- Полив: нечастый и умеренный: признаком потребности во влаге является утрата листьями тургора.
- Подкормки: необязательны, но при выращивании в бедном грунте лучше подкормить растение раствором комплексного минерального удобрения через неделю после высадки рассады в сад, а еще через 2-4 недели можно внести вторую подкормку. С сентября участок не удобряют. Если вы растите статицу в плодородном грунте, в дополнительных удобрениях нет нужды.
- Размножение: семенное.
- Вредители: практически не поражается.
- Болезни: ботритис, белая плесень.
Подробно о выращивании статици читайте ниже
Ботаническое описание
Кермек татарский представляет собой многолетнюю траву или полукустарник с крупными, чаще прикорневыми листьями, образующими большую розетку, и прямыми безлистными, но густо опушенными стеблями высотой от 30 до 90 см. Мелкие пятичленные цветки кермека с чашечками белого, желтого, голубого, синего, фиолетового, лососевого, розового, малинового или пурпурного цвета собраны в колоски, которые образуют щитки или метелки. Цветение статицы длится с июля до морозов, а семена не теряют всхожести 4-5 лет.
Советы по уходу за альстромерией – проверены временем
Растение кермек неприхотливо, как сорняк, но популярность у садоводов оно завоевало не только этим своим качеством. Достоинством статицы является ее высокая устойчивость к болезням и вредителям, дефициту влаги и другим неблагоприятным внешним факторам. Цветы кермек безразличны к составу почвы, практически не требуют ухода и не особо нуждаются в подкормках. Не переносит растение только застоя воды в корнях, тени и морозов, поэтому в средней полосе кермек многолетний выращивают в однолетней культуре.
На фото: Кермек в саду
Многолетник кермек прекрасно размножается самосевом, обильно цветет, его бахромчатые метелочки долго стоят в срезке, поэтому флористы часто используют статицу для создания композиций и букетов, в том числе и сухих.
Выращивание статицы из семян
Посев на рассаду
Перед посевом на рассаду семена кермека, заключенные в плотную оболочку, желательно скарифицировать: пройтись по их носикам наждачной бумагой или грубой пилкой, после чего выдержать их несколько часов в растворе Эпина или подержать 2-3 дня во влажных опилках.
Сеют статицу на рассаду в феврале или в начале марта, раскладывая по одному семечку в перегнойные или торфяные горшочки с влажным рыхлым стерильным субстратом. Сверху семена присыпают тонким слоем грунта, накрывают посевы стеклом и содержат при температуре 16-21 ºC. При таких условиях всходы могут появиться уже дней через 10-18. Если вы торопитесь, воспользуйтесь системой нижнего подогрева, и тогда семена прорастут раньше.
Уход за рассадой
Выращивание кермека из семян предполагает ежедневное проветривание посевов, а после появления сеянцев необходимо регулярно поливать растения и осторожно рыхлить вокруг них почву. Если вы выращиваете рассаду в ящике, контейнере или в кассетах небольшого размера, в стадии развития у сеянцев двух настоящих листьев осуществляется их пикировка в отдельные стаканчики или горшочки.
- Крокусы: выращивание в саду, виды и сорта
Не затягивайте с пикировкой: у статицы слишком объемная и быстро развивающаяся корневая система с длинным стержневым корнем.
На фото: Крупно цветки статицы
В середине апреля начинайте проводить закаливающие процедуры: выносите емкости с сеянцами ежедневно на открытый воздух, постепенно увеличивая продолжительность прогулки. Когда статица из семян сможет проводить вне квартиры целый день, ее можно высаживать в сад.
Посадка статицы в открытый грунт
Когда сажать
Выберите для растения солнечный участок, поскольку тень для него губительна. Участок может быть открытым и незащищенным от ветра, которого растение не боится. Почва предпочтительна хорошо дренированная, суглинистая или песчаная, нейтральной или слабощелочной реакции, хотя по большому счету для кермека годится любой грунт. Высаживают сеянцы в сад не раньше июня, поскольку в мае еще могут быть возвратные заморозки.
Как выращивать гипсофилу – от посадки до сбора семян
Как посадить
Из-за того, что рассада статицы плохо переносит пересадку, лунки нужно делать такой глубины, чтобы в них поместилось все содержимое стаканчика, то есть корневая система с земляным комом. Пластиковые стаканчики осторожно разрезают и снимают, растение помещают в лунку, заделывают и поливают подсоленной водой (1 столовая ложка соли на 10 л воды). Расстояние между лунками в зависимости от сорта кермека соблюдается в пределах 25-40 см.
На фото: Цветение статицы в саду
Уход за статицей
Условия выращивания в саду
Статица в открытом грунте вырастет и без вашего участия. В чем заключается уход за ней? В редких поливах и рыхлении грунта вокруг кустов с одновременным удалением сорной травы. Полив нужен только в тех случаях, когда листья начнут терять тургор. Если лето будет с дождями, можете не поливать растение вообще, но почву время от времени все-таки желательно рыхлить. В засушливое лето кермек поливают дважды за сезон, и один из этих поливов проводят подсоленной водой, растворив в ведре воды 7 чайных ложек соли.
Полив осуществляют под корень, ближе к вечеру, используя отстоянную и нагретую за день воду.
- Иберис: выращивание из семян, посадка и уход
Выращивание статицы не требует обязательных подкормок, но если она растет в скудной почве, лучше все-таки их вносить. Первую подкормку раствором комплексного минерального удобрения целесообразно провести через неделю после высадки рассады в грунт, а затем, в зависимости от плодородности почвы, ее удобряют один раз в 2-4 недели. С сентября подкормки прекращают. Статицу, растущую в плодородной почве, можно не подкармливать.
Вредители и болезни
В дождливое лето или в результате частого и обильного полива статица на клумбе может заболеть ботритисом – гнилью овощных культур, избавиться от которой можно обработкой кустов раствором фунгицида. Иногда на растении появляется белая плесень – признак заболевания оидиум. В этом случае следует прибегнуть к опрыскиванию кермека серосодержащим препаратом. В целом же статица крайне редко повреждается вредителями и болезнями, а при хорошем уходе этого не происходит вообще.
На фото: Кермек разных цветов в букете
Посадка статицы и уход за ней под силу даже начинающему садоводу, и если вам удастся вырастить рассаду кермека, то в дальнейшем никаких трудностей не предвидится.
Статица после цветения
Некоторые виды статицы могут выдержать морозы до -30 ºC, но эти растения требуют определенной подготовки к зиме. Когда зимостойкий кермек начнет желтеть и усыхать, обрежьте его листья и стебли на уровне земли, после чего укройте его соломой, хвоей, листьями или хворостом, а поверх них уложите нетканый укрывной материал, который будет защищать кермек не так зимой от мороза, как весной от талых вод. Материал нужно чем-нибудь прижать к земле.
Уход за лилиями в саду – всё, что нужно знать
Из срезанных соцветий статицы можно сделать сухие букеты. Срезают соцветия еще до того, как они начнут сохнуть и выгорать на солнце. После срезки их держат перевернутыми и подвешенными в хорошо проветриваемом сумрачном помещении до полного высыхания. Сухоцвет кермек сохраняет яркость своих чашечек более года.
Виды и сорта
Чаще всего в культуре выращивают такие виды статицы:
- Как вырастить рассаду ипомеи перистой: посев и пикировка
Статица Суворова (Limonium suworowii)
Или подорожникоцветник Суворова (Psylliostachys suworowii) – вид высотой около 60 см с длинными колосовидными соцветиями из розовых или розово-сиреневых цветков.
На фото: Статица Суворова (Limonium suworowii)
Статица Гмелина (Limonium gmelinii)
Это зимостойкий многолетник высотой до 50 см с сине-фиолетовыми цветками, собранными в крупное щитковидное соцветие:
Кермек широколистный (Limonium latifolium)
Растение высотой 60-75 см с крупными прикорневыми листьями и сине-фиолетовыми цветками, собранными в раскидистое метельчатое соцветие.
Лучшими сортами этого вида являются:
- Виолетта – растение с густо-фиолетовыми соцветиями;
- Блу Клауд – сорт с цветками лавандового оттенка.
На фото: Кермек широколистный (Limonium latifolium)
Кермек Переса (Limonium perezii)
Вид, распространенный на Канарских островах, где он и был введен в культуру. Статица Переса – растение с побегами высотой до 60 см и декоративными крупными соцветиями фиолетового оттенка, которые флористы охотно используют как для свежих, так и для сухих композиций.
На фото: Кермек Переса (Limonium perezii)
Кермек Бондуэлли (Limonium bonduellii)
Родом из Северной Африки. Это многолетник высотой до 90 см с нежными стеблями без гребневых выростов и рыхлыми соцветиями, состоящими из крупных цветков желтой или белой окраски. В культуре вид с 1859 года. Сортов статица Бондуэлли не имеет, но ее семена часто включают в цветочные смеси.
Кермек китайский (Limonium sinensis)
Введен в культуру относительно недавно. В условиях умеренного климата этот многолетник возделывается как однолетнее растение с прикорневой розеткой из глянцевых плотных листьев, из центра которой поднимаются многочисленные тонкие цветоносы высотой от 50 до 70 см, несущие ажурные соцветия из мелких желтых цветков, окруженных кремовыми или белыми воронковидными околоцветниками.
Лучшие сорта статицы китайской:
- Конфетти – растение высотой 45-50 см с изящными бело-кремовыми соцветиями;
- Элегант – сорт высотой до 70 см с такими же кремово-белыми цветками.
На фото: Кермек китайский (Limonium sinensis)
Кермек выемчатый (Limonium sinuatum)
Родом из Малой Азии и Средиземноморья. Это травянистый многолетник, культивируемый в однолетней культуре. Стебли у растений этого вида высотой до 60 см, многочисленные продолговатые тонкие прикорневые листья светло-зеленого оттенка, перисто-лопастные или перисто-раздельные, располагаются на коротких черешках. Цветоносы приподнимающиеся или прямостоячие, в верхней части ветвистые. У мелких цветков диаметром до 1 см сухие опушенные колесовидные чашечки розового, белого или сине-фиолетового оттенка и беловатый или бледно-желтый венчик. В культуре этот самый популярный среди садоводов вид с 1600 года. В продаже вы можете встретить импортные и отечественные цветочные смеси статицы выемчатой. Например:
- статица Крымская – смесь растений высотой от 30 до 80 см розового, синего, желтого или фиолетового оттенка;
- Микст Хайбридз – сорта высотой до 45 см с пурпурными, белыми, желтыми, голубыми и розовыми соцветиями;
- статица Суприм – серия сортов высотой около 60 см разных расцветок;
- Шамо – серия сортов высотой до 70 см разных оттенков лососевого цвета;
- Фортресс – высота кустов 70-80 см, цветки пурпурные, желтые, белые, синие или розовые;
- Компинди – серия сортов с голубыми, синими и розовыми цветками на кустах высотой до полуметра;
- серия Петит Буке – компактные кустики высотой до 30 см, обильно покрытые соцветиями пастельных тонов: белыми, голубыми, сиреневыми, нежно-розовыми или кремовыми.
На фото: Кермек выемчатый (Limonium sinuatum)
Кроме разноцветных смесей можно приобрести одноколерные сорта статицы выемчатой:
- Блу Ривер – растение высотой около 50 см с небесно-голубыми соцветиями;
- Эприкот – сорт высотой около 60 см с лососево-розовыми цветками;
- Лавендел – куст высотой до 80 см с лавандовыми цветками;
- Айсберг – сорт высотой 75 см с белыми соцветиями;
- Нахтблау – темно-синие соцветия на кустах высотой до 90 см;
- Розеншиммер и Эмэрикэн Бьюти – карминово-розовые цветки на кусте высотой 60 см.
Литература
- Читайте по теме на Википедии
- Особенности и другие растения семейства Свинчатковые org/Thing»>Список всех видов на The Plant List
- Дополнительная информация на World Flora Online
Спирея: описание выращивания в саду, виды и сорта
Стевия: выращивание, свойства, виды и сорта
Разделы: Садовые растения Садовые многолетники Садовые травянистые растения Садовые цветущие растения Садовые полукустарники Растения на К Растения на С Свинчатковые (Плюмбаговые)
После этой статьи обычно читают
Добавить комментарий
Seed — Bilder und Stockfotos
2.616.061Bilder
- Bilder
- Fotos
- Grafiken
- Vektoren
- Videos
Niedrigster Preis
SignatureBeste Qualität
Durchstöbern Sie 2.
616.061 seed Stock -Фотография и фотографии. Odersuchen Sie nach saat oder рассады, um noch mehr faszinierende Stock-Bilder zu entdecken. фрау hält frisch produzierte samenkugeln oder samenbomben auf blauem hintergrund. kopierraum — стоковые фотографии и изображения семянFrau hält frisch produzierte Samenkugeln oder Samenbomben auf…
junger apfelsprossimen im boden — seed stock-fotos und bilderJunger Apfelsprossimen im Boden
säen pflanzensamen von hand — seed stock-fotos und bilderSäen pflanzensamen von hand — seed stock-fotos und bilder
Säen von Hand gartenbaubanner mit kopierraum. sämling, gießkanne und gartengeräte auf holzhintergrund. сад и флористик Флах Лиген Гренце. — фото и фотографии семян
Garten- und Gartenbaubanner mit Kopierraum. Землинг, Гиссканне…
grüner anis closeup — seed stock-fotos und bilderGrüner Anis closeup
hochwinkelansicht eines unkenntlichen älteren mannes, der die paprikasamen in kleine töpfe pflanzt — seed stock-fotos und bilderHochwinkelansicht eines unkenntlichen älteren 09 Mannes, 0 duft. .. kardamom auf holzhintergrund — фото и фото семян
duftender Kardamom auf Holzhintergrund
aquilegia samenkopf — фото и фото семянAquilegia Samenkopf
samen von schmalblättlichem lubein, lupinus angustifolius, die lupin-pflanziert картинкаSamen von schmalblättlichem Lubein, Lupinus angustifolius, Lupin-P
Ein Teller mit Samen aus grünen und schwarzen Oliven — фото и фотографии семян und leinsamen — фото и сборка семянBodybuilding-Frühstück mit Proteinreichem Hüttenkäse, Äpfeln, Nüss
frau hält und pflanzt etwas basilikumsamen in einem pflanzentopf voller frischem boden und kompost — seed Stock-fotos und BilderFrau hält und pflanzt etwas Basilikumsamen in einem Pflanzentopf…
flauschige strauchsamen makro, mandschurische clematissamen — семенной материал, фото и фотографииflauschige Strauchsamen Makro, mandschurische Clematismen
wachsende pflanzen. росток им боден. landwirtschaft und gartenbau, набор иконок. уход за ростками, линейные иконки. pflanze im boden, gewächshaus und hydroponische systeme. Bearbeitbare schlaganfälle — графика семян, клипарт, мультфильмы и символыWachsende Pflanzen. Росток в Бодене. Landwirtschaft und Gartenbau,
gartenarbeit тонкие линии иконки — редактируемый штрих — семенной сток-графика, -клипарт, -мультфильмы и -символGartenarbeit Thin Line Icons — редактируемый штрих
Olivensamen zum anbauen eines Olivenbaums — seed stock-fotos und bilderOlivensamen zum Anbauen eines Olivenbaums
schnittlauch und schnittlauchsamen — фото и фотографии семянSchnittlauch und Schnittlauchsamen
schnittlauch und schnittlauchsamen — фото и фотографии семянSchnittlauch und Schnittlauchsamen
nahaufnahme des KnoblauchpFlanzProzesses — фото и сборка семян Löwenzahn 2 natur in spring — seed stock-fotos und bildernatur in spring
pflanzensämlinge, die in der sonne wachsen. дом — семенные стоковые фотографии и изображенияPflanzensämlinge, die in der Sonne wachsen. Hausgartenarbeit.
verschiedene bunte superfoods in schalen auf dunklem hintergrund — seed stock-fotos und bilderVerschiedene bunte Superfoods in Schalen auf dunklem Hintergrund
spargelsamen, früchte und schwarzkümmelkapseln auf einem holzbrett — seed stock-fotos und bilderSpargelsamen, Früchte und Schwarzkümmelkapseln auf einem. ..
nahaufnahme der mit kompost gefüllten vermehrungsschale mit eingeklemmtem kosmossämling, steckpflanzen in kompost, gartenkonzept, fokus im vordergrund — seed stock-fotos und bilderNahaufnahme der mit Kompost gefüllten Vermehrungsschale mit…
köstliche und herzhafte cashewnüsse — seed stock-fotos und bilderKöstliche und herzhafte Cashewnüsse
samen von radieschen — seed stock-fotos und herzhafte 900menschen Stock-3 von Radies2 Samen 0 Radies und bilder
Grassamen
bild von hausgemachtem apfelobstkuchen in fettdichtem backpapier ausgekleidetes backblech auf küchentheke, hausbacken, erhöhte ansicht — seed stock-fotos und bilderBild von hausgemachtem Apfelobstkuchen in fettdichtem Backpapier. ..
schwarzäugige susan-rebe und samen — seed stock-fotos und bilderschwarzäugige Susan-Rebe und Samen
alcea blüht samen isoliert auf weißem hintergrund. — фото и фото семянAlcea blüht Samen isoliert auf weißem Hintergrund.
junges nadelbaum-anbaukonzept — фото и фото семянJunges Nadelbaum-anbaukonzept
rohe bio fenchelsamen — фото и фото семянRohe Bio Fenchelsamen
nadelbaum-zapfen-kieferngewächse (nadelbaum-seundgewächse)0002 Nadelbaum-Zapfen-Kieferngewächse (Nadelbaumgewächse) schwarze samen in hülsen und blättern einer irispflanze im garten, nahaufnahme. saisonale reifung der ernteblumen. gartenbau, anbau und gartenbau — стоковые фото и фото семянSchwarze Samen in Hülsen und Blättern einer Irispflanze im Garten,
apple samen isoliert auf weiß — фото семян и фотоApple Samen isoliert auf weiß
landwirtschaft und gärtnerschaft und garten. затц фон символен. gärtner pflanzenanbau und pflege. wie man wächst. самен сэн. вектор флач. оффене пфаде. беарбейтбарер контур. — семенной сток-графика, -клипарт, -мультфильмы и -символLandwirtschaft und Gärtner. Сац фон Символен. Gärtner…
veganes brot — фото и фотографии семянVeganes Brot
ahornbaumsamen auf weißem hintergrund — посадочное фото и изображенияAhornbaumsamen auf weißem Hintergrund
im garten blüht petersilie — seed stock-fotos 02blülder Petersilie birkenzweige mit frischen grünen blättern und samen. der zweig einer birke schließt sich mit grünen blättern und herabhängenden kätzchen. селективный фокус. birkenzweig, betula pendula — фото и фотографии семянBirkenzweige mit frischen grünen Blättern und Samen. Der Zweig…
sorten von getreide Samen und rohen quino — фото и фото семянSorten von Getreide Samen und rohen Quino
gras aus samen — посадочное фото и фотоGras aus Samen
укроп самен verschüttet aus einem teelöffel — фото и фото семянDill Samen verschüttet aus einem Teelöffel
feuerwerk im wald — фото и фото семянFeuerwerk im Wald
abstrakter natürlicherhintergrund weicher pflanzen (cortaderia selloana) — фото и фото семянAbstrakter natürlicher Hintergrund weicher Pflanzen (Cortaderia. ..
chia-samen isoliert auf weißemhintergrund — seed stock-fotos und bilderChia-Samen isoliert auf weißem Hintergrund
frau im sommermalgarten pflückt seed-venpbmitn blumen samen fotos und bilderFrau im Sommergarten pflückt trockene Blumen Samen mit…
weißer topf mit zitronensprossen auf der fensterbank — seed stock-fotos und bilderweißer Topf mit Zitronensprossen auf der Fensterbank
vier tomaten-setzlinge — фото и фото семянVier Tomaten-Setzlinge
traubenbündel nahaufnahme traubenscheiben mit samen in einem schnitt — seed stock-fotos und bilderTraubenbündel Nahaufnahme Traubenscheiben mit Samen
3… fotos und bilderbohnen in einer schüssel mit wasser einweichen — фото и фотографии
Bohnen in einer Schüssel mit Wasser einweichen
nahaufnahme eines löwenzahns — seed stock-fotos und bilderNahaufnahme eines Löwenzahns
Büttenpapier — фото и фотографии семянBüttenpapier
set aus chiasamen auf weißemhintergrund, dre. banner-design — seed stock-fotos und bilderSet aus Chiasamen auf weißem Hintergrund, Dre. Banner-Design
gehackte cashew-nüsse (nahaufnahmen, selektiver focus) — фото и фото семян в Holzlöffeln und Öl auf rustikalem Holztisch wachsende pflanze. grüner sross, der aus samen wächst. — фото и фото семянWachsende Pflanze. Grüner Spross, der aus Samen wächst.
фон 100Seed Stock-Fotos und Bilder — Getty Images
- CREATIVE
- EDITORIAL
- VIDEOS
- Beste Übereinstimmung
- Neuestes
- Ältestes
- Am beliebtesten
Alle Zeiträume24 Stunden48 Stunden72 Stunden7 Tage30 Tage12 MonateAngepasster Zeitraum
- Lizenzfrei
- Lizenzpflichtig
- RF und RM
Lizenzfreie Kollektionen auswählen >Editorial-Kollektionen auswählen >
Bilder zum Einbetten
Durchstöbern Sie 276.
846 seed Stock-Fotografie und Bilder. Odersuchen Sie nach saat oder рассады, um noch mehr faszinierende Stock-Bilder zu entdecken. pflanzen-iconen — серия classic line — графика семян, -клипарт, -мультфильмы и -символы, фрау сэн самен им боден — сток-фото и бильдервильд самен — сток-фото и бильдерсаатгут bereit, im garten gepflanzt zu werden — стоковые фото и бильярдный ассортимент семян от nussen auf rustikalen holztisch. — семенной сток-фото и бильдеркинтро-самен — семенной сток-фото и бильдеркрупный план семян, высыпающихся из бумажного пакета на белом фоне — семенной сток-фото и бильдердерево саженец рука сажает росток в почву с закатом крупным планом мужская рука сажает молодое дерево над зеленый фон — семенной сток-фото и бильдерпосадка саженцев молодые растения в утреннем свете на фоне природы — семенной сток-фото и бильдермейн kostbarkeit — семенной сток-фото и бильдерфенхель — семенной сток-фото и бильярд из сухих семян тмина — семенной сток-фото und bilderweizenbeerenhintergrund-seedstock-fotos und bilderleben eines bean-seed Stock-fotos und bildersorten von getreide samen und rohen quino-seed Stock-fotos und bilderwachsende-seed Stock-fotos und bilderdandelion seed-seed Stock-fotosund bildervarious super food зерна — семенной сток-фотографии и бильдермуттерн-символ-набор — семенной сток-график, -клипарт, -мультфильмы и -символынарезанный виноград на стеблях — семенной сток-фото и бильдермуттерн-сор timement auf rustikalen holztisch. — семенной сток-фото и бильдерон с одним вырезом из семян одуванчика на белом — семенной сток-фото и бильдерженская рука, семя и горшок. — семенной сток-фотографии и бильдералмонд орех, изолированные на белом фоне — семенной сток-фотографии и бильдерные leben, isoliert auf weißemhintergrund (xxxl — семенной сток-фотографии и бильдеркропп ручной посев семян в почву — семенной сток-фото и бильдерсаен pflanzensamen von hand — семенной сток-фото и бильдертоматен-сетцлинге — семенной сток-фотос и бильдерсовинг-ручной — семенной сток-фотос и бильдермуттер унд тохтер säen grüne erbsen samen im frühling gemüsegarten — семенной сток-фото и бильдерпфланцен унд дас вахсен дер символ — семенной сток-график, -clipart, -cartoons und -symbolegroße gruppe von vollkorn-lebensmittel auf rustikalen holztisch geschossen — запас семян-фото и бильдерформ — запас семян-фото и бидерлёвенцан — запас семян-фото и изображения молодая женщина сажает рассаду цветов в почву с помощью садовой лопаты в солнечный весенний день садоводство в вашем дворе или на заднем дворе — стоковые фотографии и сборка орехов и семян, аккуратно организованные — стоковые фотографии и сборка семян pflanze — запас семян k-fotos und bilderpile органических зерен овса — стоковые фото и бильярдные изображения — стоковые фото и бильдерпфланцен и символ — семенной сток-графика, -клипарт, -мультфильмы и -символы и семена — семенной сток-фото и бильдероранжевый экстремальный крупный план — семенные фото и фотокрупный план семян льна, выделенных на белом фоне — семенные фото и бильдервайцен-зерно-лидер — семенные фото и бильдермид взрослая женщина сажает семена в цветочный горшок, сидя в огороде — семенной сток-фото и бильдерлюфтауфнахме вахсендер babypflanzen — семенной сток-фото и бильдерспроутс вайцен — семенной сток-фото и бильдерди самен дер либе сэн — семенной сток-график, -клипарт, -мультфильмы и -символеканнабис семена конопли крупным планом макросъемка изолированы — саженец дубового дерева (Quercus robor) и желудь (seed stock-fotos und bilderclose-up) травяных саженцев на земле — семенной сток-фото и бильдермюсли — семенной сток-фото и бильдерный фермер обрабатывает поле своим трактором — семенной сток-фото и бильдерхэнд halten neues wachstum pflanze-dunklemhintergrund — семенной сток-фото и бильдергартенарбайт тонкая линия значки — редактируемый штрих — семенной сток-график, -клипарт, -мультфильмы и -символикакао-бобы — семенной сток-фотографии и бильдерхэнде halten neues wachstum werk im sonnenuntergang — семенной сток-фото и бильдерсоджабоне — семенной сток-фото и бильдерокра семена на мужской ладони ,close up — стоковые фотографии и изображения из 100SeedExtractor: графический интерфейс с открытым исходным кодом для анализа изображений семян
Введение
Большая часть растительной пищи, которую мы едим, состоит из семян или продуктов, полученных из них. Таким образом, большая часть ресурсов в программах улучшения урожая инвестируется в более качественные семена. В этом контексте получение точных измерений размера и формы семян имеет решающее значение как для селекционных программ, направленных на повышение урожайности, так и для содействия фундаментальным исследованиям, направленным на обнаружение генетических компонентов, регулирующих размер семян. Ручные измерения размера семян свидетельствуют о ограниченных параметрах, таких как длина и ширина, с низким разрешением, что может быть подвержено ошибкам и требует много времени. Механизированное оборудование для измерения размера семян стоит дорого, требует регулярной калибровки и часто требует прохождения через систему большого количества семян. Напротив, автоматизированные платформы на основе изображений, предназначенные для точного измерения параметров семян, предлагают эффективное решение для смягчения временных ограничений, проблем с количеством семян и обхода ошибок, допущенных вручную (Furbank and Tester, 2011; Fiorani and Schurr, 2013; Sandhu et al. , 2019; Ян и др., 2020). Кроме того, высокопроизводительный анализ изображений представляет собой мощный инструмент для обнаружения признаков, который обеспечивает более быстрый ввод данных для последующего анализа, такого как полногеномные ассоциативные исследования (GWAS) для выполнения генетического картирования признаков, связанных с урожайностью.
Качественная оценка признаков, связанных с урожайностью, также может быть важна для обеспечения оптимальной питательной ценности семян (Zhao et al., 2020). В этих рамках цвет семян может быть связан с усиленным питанием (Shao et al., 2011 и ссылки в нем). Например, цветные сорта риса обладают антиоксидантными свойствами, которые, как известно, снижают риск развития сердечно-сосудистых заболеваний (Ling et al., 2001). Аналогичным образом, пигментированные семена кукурузы оказывают благотворное влияние на здоровье человека благодаря своим антиоксидантным свойствам (Casas et al., 2014; Petroni et al., 2014). В дополнение к своим лечебным свойствам цветные сорта риса имеют культурное значение для определенных регионов и, следовательно, ценятся на соответствующих местных рынках (Finocchiaro et al. , 2007). Кроме того, пшеница с красным пигментом, устойчивая к прорастанию перед сбором урожая, широко использовалась в программах селекции пшеницы (Groos et al., 2002).
Принимая во внимание важность размера и цвета семян, было разработано несколько приложений для анализа изображений семян. Например, SmartGrain определяет морфометрические параметры семян, такие как площадь, периметр, длина и ширина, а также форму семян. Однако он не извлекает информацию о цвете семян (Tanabata et al., 2012). С другой стороны, GrainScan предоставляет информацию о размере и цвете семян (Whan et al., 2014). Оба приложения могут работать только на платформе Windows. Хотя эти приложения обеспечивают высокий уровень точности анализа изображений семян для определения размера и формы, корректировки, которые могут потребоваться при настройке параметров, ограничены. Например, SmartGrain позволяет пользователю определять только цвета переднего плана и фона, в то время как GrainScan позволяет пользователю только устанавливать параметры размера. Кроме того, обработка большого количества изображений требует много времени, а изображения с неравномерным освещением создают проблемы для точных измерений, которые могут помешать последующему анализу. Эти приложения не имеют открытого исходного кода и, следовательно, не могут быть усовершенствованы в соответствии с потребностями пользователей. Кроме того, другие инструменты, такие как SeedSize (Moore et al., 2013) и Plant Computer Vision или Plant CV можно использовать для определения морфометрии семян (Fahlgren et al., 2015; Gehan et al., 2017).
Чтобы устранить недостающие функции в доступном программном обеспечении для анализа изображений семян, мы разработали инструмент на основе MATLAB — SeedExtractor , программное обеспечение с открытым исходным кодом с графическим пользовательским интерфейсом (GUI), которое позволяет пользователю проводить анализ размера семян с высокой точностью. Наше приложение, основанное на библиотеках обработки изображений в MATLAB, отличается высокой эффективностью, так как может обрабатывать большое количество образцов за короткий промежуток времени. Приложение позволяет пользователю точно настраивать параметры обработки изображений и может обрабатывать широкий спектр изображений. Самое главное, что наше приложение имеет открытый исходный код, поскольку исходный код нашей программы опубликован, а MATLAB доступен большинству пользователей по институциональной лицензии. Более того, мы разработали Standalone версию SeedExtractor , который использует MATLAB Compiler Runtime и не требует лицензии MATLAB для своей работы. В целом, наш инструмент позволяет пользователю свободно модифицировать приложение в соответствии с более конкретными потребностями. В качестве тестового примера для изучения ценности этого программного обеспечения мы провели скрининг зрелых семян 231 образца риса, соответствующего панели разнообразия риса 1 (RDP1) с различными генетическими ( indica, умеренный japonica, тропический japonica, aus и смешанный ). и географические фоны с использованием SeedExtractor . Полученные признаки, связанные с размером семян, такие как длина и ширина зрелых семян, использовались для выполнения GWAS. Наше картирование ассоциаций подтвердило идентичность известных локусов/генов, регулирующих длину семян ( GS3 ) и ширину ( qSW5 ) у риса, тем самым подтвердив точность этого приложения для облегчения генетического анализа и обнаружения признаков.
Материалы и методы
SeedExtractor Рабочий процессSeedExtractor — это приложение на основе MATLAB, что делает его совместимым с несколькими операционными системами. Инструмент доступен в двух форматах: Standalone и Regular (см. раздел «Доступность ПО»). Автономная версия SeedExtractor использует «MATLAB Compiler Runtime» и не требует лицензии MATLAB для своей работы. Для работы обычной версии требуется лицензия MATLAB. Обе эти версии похожи по своему интерфейсу и производительности. Во-первых, пользователю необходимо установить Приложение SeedExtractor . Затем должны быть предоставлены папки, содержащие исходные изображения (отсканированные изображения или изображения с камеры) (см. рис. 1). Затем устанавливаются параметры в соответствии с требованиями пользователя и тестируется отдельное изображение для подтверждения оптимальных настроек (см. рис. 1). Последовательно может быть проведена пакетная обработка для извлечения исходных признаков, таких как (1) площадь, (2) периметр, (3) длина большой оси (длина), (4) длина малой оси (ширина), (5) округлость, (7) ) начальное число, (8) интенсивность цвета (разные каналы) и другие характеристики, полученные в цифровой форме, такие как центроид. Мы предоставили пошаговое руководство по использованию SeedExtractor (см. Руководство по SeedExtractor : Дополнительный лист технических данных 1).
Рис. 1. Рабочий процесс SeedExtractor . Во-первых, загружаются начальные изображения и устанавливаются параметры. Тестирование параметров выполняется для обеспечения оптимальных настроек. Затем можно провести пакетную обработку для извлечения признаков семян.
Внедрение программного обеспечения
Разработка инструментов
Мы разработали графический интерфейс на основе MATLAB, который предоставляет пользователям возможность гибкой настройки уникальных параметров для обработки исходных изображений (см. рис. 2).
Рис. 2. Графический пользовательский интерфейс SeedExtractor . Цифры обозначают пошаговое руководство по использованию приложения: (1) указан путь к исходным изображениям (* означает, что все изображения в определенной папке нуждаются в оценке), (2) файлы загружаются автоматически, ( 3) необходимо выбрать цветовое пространство, (4) можно использовать счетчик для изменения текущего изображения (показанного на исходном изображении), (5) пользователь может выбрать опцию « гистограмма » (если применимо), (6 ) будут созданы гистограммы, представляющие распределение цветов в трех каналах выбранного цветового пространства, (7) диапазон гистограмм можно использовать для установки параметров цвета для соответствующего канала, (8) выбрав « передний план » и « фон » — пользователь может набросать, чтобы определить цвет начального и фонового изображения соответственно, а « графическое вырезание » облегчит отделение начальных значений от фона, (9) минимум и максимум определены параметры размера начального числа (могут быть выполнены либо настройки по умолчанию, либо ручные исправления) для фильтрации областей, которые не являются начальными значениями, (10) пользователь может « измерить » объектов, которые использовались в качестве масштаба на изображении и (11 ) определить размер масштаба (в миллиметрах), который поможет преобразовать длину пикселя в метрические единицы, (12) перед пакетной обработкой следует выполнить тестовый прогон, чтобы убедиться, что настройки параметров оптимизированы, (13) если пользователь решил, какие параметры будут оптимальными, можно инициировать пакетную обработку, и (14) прогресс можно отслеживать с помощью индикатора выполнения.
Этапы выполнения
Ниже приведено краткое пошаговое руководство для выполнения анализа начального изображения: (1) указание пути, (2) загрузка файла, (3) выбор цветового пространства, (4) выбор изображения, (5) ) генерация гистограммы, (6) установка параметров, (7) нарезка графика, (8) измерение масштаба и (9) тестирование и обработка.
Спецификация путиSeedExtractor совместим с широко используемыми форматами изображений, включая jpg , png и размолвка . Этот инструмент поддерживает пакетную обработку, загружая все изображения с помощью регулярного выражения. Например, «ИМЯ ПАПКИ \ ∗ .jpg » загружает все изображения jpg в соответствующую папку.
Загрузка файлаПосле ввода правильного регулярного выражения в текстовое поле « Путь » можно нажать кнопку « Загрузить », чтобы загрузить все имена файлов в приложение. Лампочка », расположенный в правой части интерфейса, станет красным во время загрузки имен файлов. После этого необработанное изображение будет отображаться в « Исходное изображение » (см. рис. 2). Спиннер можно использовать для изменения индекса текущего изображения. Текущее изображение будет использоваться для настройки параметров и тестирования на последующих этапах.
Для точных измерений « Исходное изображение » и « Обработанное изображение » можно увеличивать и уменьшать для проверки любых расхождений между исходным изображением и обработанным изображением в двоичном формате. Их также можно перемещать, удерживая левую кнопку мыши.
Выбор цветового пространстваПриложение поддерживает три различных цветовых пространства: (1) красный, зеленый и синий ( RGB ), (2) оттенок, насыщенность и значение ( HSV ) и (3) ) Лаборатория . Эти три разных варианта цветовых пространств обеспечивают пользователю гибкость при поиске оптимального вывода сегментации. После выбора цветового пространства изображения будут обрабатываться в соответствующем цветовом пространстве для следующих шагов.
Генерация гистограммыГенерируются три гистограммы ( Канал 1 , 2 и 3 ; см. рис. 2), показывающие распределение цветов в трех каналах выбранного изображения (начальный и фон). Значение каналов зависит от цветового пространства, выбранного пользователем. Например, если в качестве предпочтительного цветового пространства выбрано « RGB », то гистограммы для « Канал 1 , 2 и 3 » относятся к « красный 9019».2, зеленый и синий. » Аналогично, « оттенок , насыщенность и значение » для « HSV » и « l , a , и b цвет 9. пробел 9.2b La ». Распределение цветов в этих трех каналах можно использовать в качестве ориентира для установки правильных цветовых диапазонов. Предоставляются параметры по умолчанию; однако пользователю необходимо изменить параметры цвета, чтобы использовать свой предпочтительный диапазон цветовых каналов на основе гистограмм (см. 9).0191 Графическая резка ).
Настройка параметровНабор параметров по умолчанию автоматически загружается после запуска инструмента. Диапазоны каналов (минимум и максимум) используются для отделения исходных областей от фона. Минимальный и максимальный размер начальных значений и параметры формы, такие как площадь, длина большой и малой осей, используются для фильтрации областей, которые не являются начальными. Однако параметры по умолчанию могут работать не для всех типов исходных изображений или изображений. Таким образом, в этом случае пользователю может потребоваться установить эти параметры вручную.
Вырезка графикаЧтобы упростить процесс настройки параметров, наше приложение также может автоматически генерировать параметры на основе « пользовательских каракулей » для выбора переднего плана и фона. Затем с помощью алгоритма « GraphCut » (Kwatra et al., 2003) можно отделить передний план от фона.
Чтобы выбрать передний план (т. е. в данном случае начальный план), пользователь может нажать кнопку « передний план », которая откроет новое окно. Пользователь может нацарапать семя, используя красную метку (см. рисунок 3A). В случаях, когда начальное значение слишком мало, пользователь может увеличить изображение внутрь для каракулей. После этого « Исходное изображение ” можно восстановить. Чтобы выбрать фон, пользователь может нажать кнопку « background », которая откроет новое окно. Затем пользователь может рисовать на фоне с помощью зеленой метки (см. рис. 3B).
Рис. 3. Выбор измерений переднего плана, фона и масштаба. Используя функцию « пользователь рисует », SeedExtractor может выбирать передний план и фон. (A) Чтобы выбрать передний план, пользователь может щелкнуть кнопку « передний план ” на графическом интерфейсе пользователя и нарисуйте на семени красную метку. Изображение можно увеличить внутрь, чтобы набросать более мелкие семена. (B) Для выбора фона пользователь может нажать кнопку « background » и нарисовать на фоне зеленую метку. (C) Для измерений в метрической шкале приложение позволяет пользователю измерять объекты, которые использовались в качестве масштаба изображения, которые затем можно использовать для преобразования длины пикселя в миллиметры. Для этого можно провести синюю линию, нажав кнопку «9».0191 Измерить ”кнопка. Когда линия будет нарисована, длина синей линии в пикселях появится в текстовом поле « Длина (пиксель) ». Пользователь может ввести соответствующую длину синей линии в текстовое поле « Длина (мм) ». Затем приложение автоматически преобразует выбранные значения в метрические единицы.
После того, как передний план и фон были отмечены или выбраны, пользователь может нажать кнопку « GraphCut », чтобы отделить семена от фона. Изображение, показывающее маску переднего плана, будет показано в “ Обработанное изображение ” вид. После выбора « GraphCut » гистограммы, соответствующие только начальной области, будут отображаться в « Channel 1 , 2 и 3 », чтобы помочь пользователю в настройке цветовых диапазонов. Реализация функции « GraphCut » может занять несколько дополнительных секунд. На дополнительном рисунке S5 показаны гистограмма и настройка параметров с « GraphCut » и без него.
Из-за большого разнообразия размеров и цветов семян трудно автоматически установить оптимальные диапазоны размеров и цветов (для всех цветовых пространств). В этом контексте инструмент предоставляет пользователю возможность устанавливать эти параметры вручную на основе гистограмм. Настоятельно рекомендуется, чтобы пользователь корректировал параметры путем тестирования. Тем не менее, автоматически сгенерированные параметры цвета и размера начальных значений по умолчанию обеспечивают хорошие начальные значения для пользователя, чтобы инициировать настройку параметров.
Измерение масштабаЧтобы получить начальные размеры в метрической системе, приложение позволяет пользователю измерять объекты, которые использовались в качестве масштаба на изображении (лента на рисунке 3C). Известный размер шкалы можно использовать для преобразования длины пикселя в миллиметры (мм), таким образом, представляя извлеченные значения признаков в метрической системе. Для этого можно провести синюю линию, нажав кнопку « Измерить ». Когда линия будет нарисована, длина синей линии в пикселях появится в « Длина (пиксель) ”текстовое поле. Пользователь может ввести соответствующую длину синей линии в текстовое поле « Длина (мм) » (см. рис. 2). Затем приложение автоматически преобразует эти значения в метрические единицы.
Тестирование и обработкаПосле того, как пользователь установил параметры для изучения их работы, перед пакетной обработкой необходимо выполнить тест. Чтобы проверить работоспособность текущих параметров, пользователь может нажать кнопку «9».0191 Тест ”кнопка. Изображение, показывающее маску семян, будет показано на графике « обработанное изображение ». Существует флажок « Seed Number », который используется для управления тем, будут ли пронумерованы исходные области в обработанном изображении или нет. Если поле отмечено галочкой, ряд пронумерованных желтых полей будет нарисован в нижних правых углах отдельного начального числа в бинарном изображении.
Если пользователь выбрал параметры, которые будут использоваться, может быть запущена пакетная обработка. Приложение требует, чтобы семена не касались друг друга при отображении. Обработка начнется после нажатия кнопки « Запуск ”кнопка. Приложение извлечет ряд признаков, а извлеченные признаки будут экспортированы в виде файлов CSV. « Лампочка » станет красной во время обработки изображений и станет зеленой по завершении обозначенного задания. Датчик « Progress » покажет ход обработки изображения.
Для каждого обработанного изображения программа SeedExtractor создаст выходной файл, содержащий информацию о характеристиках отдельного начального числа в конкретном изображении. Аналогично, маска исходных областей каждого изображения будет сгенерирована как обработанное изображение. На обработанном изображении отмечены индексы всех исходных областей. Кроме того, пользователь может загрузить комбинированный файл (обозначенный как TotalResult.csv), представляющий среднее значение определенного признака для всех семян на изображение из консоли MATLAB.
Алгоритмы
Сегментация изображения
Передний план с семенами необходимо отделить от фона для обработки изображения. Мы используем метод цветового порога, чтобы найти исходные области. Мы позволяем пользователю сегментировать изображения в одном из трех цветовых пространств: RGB, HSV и Lab. Цветовым пространством по умолчанию является HSV, поскольку мы заметили, что цветовые пространства HSV и Lab лучше учитывают потенциально неравномерное освещение изображений. Диапазон (минимум C i_ min и max C i_ max ) канала i th в настройках параметра цвета используется для определения цветовых диапазонов в выбранном цветовом пространстве. More specifically, if C 1 , C 2 , and C 3 are the three values of a pixel in the selected color space, a pixel satisfying the following inequalities будет идентифицирован как начальный пиксель:
C1_min где && означает логическую операцию и . Обработанное изображение, используемое в качестве маски исходных областей, может быть сгенерировано после пороговой обработки цвета в выбранном цветовом пространстве (Bruce et al., 2000). Приложение определяет каждую исходную область в двоичном формате. Признаки формы извлекаются из бинарного или обработанного начального изображения, а цвета извлекаются из исходного цветного изображения. В настоящее время это приложение предоставляет ряд признаков, таких как число семян, площадь, периметр, длина, ширина, округлость и центроид, а также интенсивность цвета семян (см. Таблицу 1). В этом программном обеспечении область A определяется количеством пикселей внутри области, а периметр P определяется длиной границы области. Длины большой (начальная длина) и малой (ширина исходной) оси — это длины большой и малой осей эллипса, которые имеют те же нормированные вторые центральные моменты, что и область. Круглость рассчитывается как (4π A )/ P 2 и может использоваться для оценки того, насколько область похожа на окружность. Центроид — это центр исходной области, которая содержит два значения координат. Интенсивность цвета — это средняя интенсивность значений интенсивности красного, зеленого и синего каналов для каждой исходной области. Таблица 1. Признаки, оцененные с помощью SeedExtractor . Чтобы проверить производительность SeedExtractor , мы оценили время, необходимое для обработки: (случай-I) изображений с разным количеством семян и (случай-II) изображений с разными уровнями разрешения (см. Таблицы S1, S2 и дополнительный рисунок S1). Для этого с помощью вычислений были сгенерированы имитационные семена и увеличены с 1 семени до 100 семян в серии изображений (случай-I). В случае II мы использовали фиксированное количество 10 семян и увеличили уровень разрешения каждого изображения с 50 × 50 до 1000 × 1000 пикселей. Сначала мы сравнили время, затрачиваемое SeedExtractor на анализ изображений (10 изображений зрелых семян разных видов риса) по сравнению с другими свободно доступными приложениями, такими как SmartGrain и GrainScan . (см. Дополнительную таблицу S3). Затем мы сравнили точность морфометрических измерений семян, полученных с помощью SeedExtractor , SmartGrain и 9019.1 GrainScan для ручных измерений с использованием цифрового штангенциркуля из углеродного волокна (разрешение: 0,1 мм/0,01 дюйма, точность: ± 0,2 мм/0,01 дюйма, питание: 1,5 В; Fisherbrand). Для этого мы учитывали только длину семени, поскольку ее можно измерить вручную с относительно более высоким уровнем достоверности, чем ширину семени. Необработанные значения ручных измерений и измерений на основе изображений представлены в дополнительной таблице S4. Чтобы показать адаптируемость приложения для измерения изображений семян других видов растений, мы проанализировали изображения, отсканированные с помощью планшетного сканера (условия контролируемого освещения) риса, пшеницы, сои, сорго, обыкновенной фасоли и подсолнечник (см. Дополнительный рисунок S2). Эти виды растений представляют широкий разброс по размеру семян. Кроме того, два дополнительных пользователя проанализировали изображения зрелых семян пяти разных видов растений, чтобы проверить согласованность результатов девяти.0191 SeedExtractor . Параметры, используемые двумя пользователями, представлены на дополнительном рисунке S3. Кроме того, чтобы проверить эффективность нашего инструмента в различных условиях освещения и фона, мы проанализировали изображения развивающихся семян риса (через 7 и 10 дней после оплодотворения), сделанные стандартной камерой смартфона (12 мегапикселей, f /1,8 апертура; см. Дополнительный рисунок S4). Приблизительно 231 образец риса из RDP1 (Liakat Ali et al., 2011; Zhao et al., 2011; Eizenga et al., 2014) выращивали в оптимальных условиях. тепличных условиях, 16 ч света и 8 ч темноты при 28 ± 1°C и 23 ± 1°C соответственно и относительной влажности 55–60 % (Dhatt et al., 2019).). Собранные метелки сушили (30 ± 1°C) в течение 2 недель, а созревшие семена очищали от шелухи с помощью Kett TR-250. Очищенные семена сканировали с помощью планшетного сканера Epson Expression 12000 XL с разрешением 600 точек на дюйм (Paul et al., 2020). Семена раскладывали на прозрачном пластиковом листе, помещенном на стекло сканера, чтобы не поцарапать. Кусок ленты шириной 0,5 дюйма (12,7 мм) использовался для масштабирования. SeedExtractor использовался для получения морфометрических измерений размера зрелых семян. Различные морфометрические измерения, полученные из отсканированных изображений семян, были проверены на нормальность, и выбросы были удалены. Данные о размерах зрелых семян (длина и ширина) были проанализированы, и скорректированные средние значения для каждого образца по повторностям были получены с помощью следующей статистической модели: yik=μ+gi+rk+ϵik , где y ik относится к продуктивности образца i th в k th повторности, μ – точка пересечения2 g 902 i is the effect of the i th accession, r k is the effect of k th replication, and ϵ ik is the residual error associated with the observation г ик . Для анализа использовалась статистическая среда R (R Core Team, 2019). Для анализа GWAS использовали скорректированные средние значения различных морфометрических показателей семян. GWAS был выполнен в пакете rrBLUP R (Endelman, 2011) с использованием массива риса высокой плотности (HDRA) набора данных маркеров однонуклеотидного полиморфизма (SNP) из 700 тыс. (McCouch et al., 2016) с общим количеством 411 066 SNP. сохраняется после фильтрации недостающих данных (<20%) и частоты минорного аллеля (<5%). Для GWAS использовалась следующая линейная смешанная модель с одним маркером: y=1μ+Xβ+sα+Zg+ϵ , где y — вектор наблюдений, μ — общее среднее значение, X — матрица расчета для фиксированных эффектов, β — это вектор основных компонентов, учитывающих структуру популяции, s — вектор, отражающий количество аллелей (0,2) каждого генотипа в конкретном локусе SNP, α — влияние SNP, Z — матрица дизайна для случайные эффекты, g∼N(0,Gσg2) — вектор случайных эффектов, учитывающих связанность, G — матрица геномных отношений генотипов, σg2 — генетическая дисперсия, ϵ — вектор остатков. Графики Манхэттена были построены с использованием пакета qqman R (Turner, 2014). Чтобы объявить полногеномную значимость SNP-маркеров, мы использовали пороговый уровень P < 3,3 × 10 –6 p или -log 10 ( P ) > 5,4 (Bai et al., 2016). Мы оценили производительность SeedExtractor в отношении времени, необходимого для обработки изображений. Для этого мы оценили два случая: изображения с разным количеством семян и изображения с разным уровнем разрешения. В первом случае мы использовали добавочный диапазон (от 1 до 100) семян в серии изображений (см. Дополнительную таблицу S1 и Дополнительный рисунок S1A). Мы заметили, что количество начальных значений не влияет на производительность, поскольку время, необходимое для обработки изображения с одним начальным числом, аналогично времени обработки изображения со 100 начальными значениями (см. рис. 4А). Во-вторых, мы использовали фиксированное количество семян и постепенно увеличивали разрешение каждого последующего изображения (см. Дополнительную таблицу S2 и Дополнительный рисунок S1B). Мы обнаружили, что производительность приложения постепенно снижается с увеличением разрешения (см. рис. 4B). Рис. 4. Тестирование производительности SeedExtractor . График, показывающий время, затраченное на обработку изображений с разным количеством начальных чисел (A) и изображений с разными уровнями разрешения (B) . Затем мы исследовали эффективность SeedExtractor в отношении времени, необходимого для анализа изображений, по сравнению с другими автоматизированными программными инструментами, такими как SmartGrain и GrainScan . Примечательно, что для анализа 10 изображений SeedExtractor требуется ~21 с, т. е. в 30 и 6 раз эффективнее, чем SmartGrain и GrainScan соответственно (см. Дополнительную таблицу S3). Затем мы сопоставили ручные измерения с анализом, выполненным с использованием каждого из трех автоматизированных программ ( SeedExtractor, SmartGrain и GrainScan ). Хотя ручные измерения подвержены ошибкам, мы учитывали только длину затравки для корреляции, поскольку она может быть измерена с относительно более высоким уровнем достоверности, чем ширина затравки. Следовательно, SeedExtractor показал наименьшее отклонение от ручных измерений, поскольку мы обнаружили корреляцию 0,93 для SeedExtractor , 0,84 для GrainScan и 0,92 для SmartGrain с длиной семян, измеренной вручную (см. Дополнительную таблицу S4). Кроме того, мы проверили корреляцию между морфометрическими измерениями, полученными с помощью SeedExtractor и двух других программ (см. Таблицу 2 и Дополнительную таблицу S5). Мы обнаружили значительно высокую корреляцию (> 0,97) между анализами, проведенными SeedExtractor и SmartGrain (см. Таблицу 2 и Дополнительную Таблицу S5). Напротив, корреляция между GrainScan и SmartGrain или SeedExtractor была относительно низкой (<0,81; см. Таблицу 2 и Дополнительную Таблицу S5). Таким образом, SeedExtractor позволяет быстро и надежно анализировать параметры размера семян. Таблица 2. Корреляция трех автоматизированных приложений для определения различных параметров размера семян. Помимо риса, размеры семян других видов растений, представляющих широкий разброс в отношении размера семян, были оценены с использованием SeedExtractor . Для этого зрелые семена пшеницы, сорго, фасоли обыкновенной и подсолнечника также обрабатывали с помощью SeedExtractor . После установления оптимальных параметров (см. Дополнительный рисунок S2 и Дополнительную таблицу S6) SeedExtractor точно сегментировал зрелые семена из разных видов растений (см. Рисунок 5). Кроме того, эти значения соответствовали значениям, полученным от двух дополнительных независимых пользователей, анализирующих эти изображения (см. Дополнительный рисунок S3 и дополнительные таблицы S6, S7, S8). Рисунок 5. Анализ семян различных видов растений. Изображения зрелых семян (исходное изображение), соответствующие рису, пшенице, сорго, фасоли обыкновенной и подсолнечнику, оценивали с помощью SeedExtractor . Обработанное изображение показывает сегментированное изображение, относящееся к соответствующим видам растений. Ленты разных цветов в исходном изображении использовались для целей масштабирования. Поскольку проанализированные изображения семян были сделаны в условиях контролируемого освещения (планшетный сканер Epson Expression 12000 XL), мы определили эффективность инструмента, проанализировав изображения проявляющихся семян риса, сделанные стандартной камерой смартфона в различных условиях освещения и фона. В результате мы смогли точно отделить развивающиеся семена риса от фона, используя SeedExtractor (см. Дополнительный рисунок S4). Таким образом, успешное и последовательное получение морфометрии семян от нескольких видов растений, а также возможность анализа изображений семян, сделанных в контролируемых и переменных условиях освещения, демонстрируют адаптивность и полезность приложения. Для проверки свойств семян, полученных из SeedExtractor , мы проверили 231 образец риса, соответствующий RDP1 (см. Дополнительную таблицу S9). Длина и ширина зрелых семян, которые показали нормальное распределение, использовались для GWAS (см. Дополнительный рисунок S6). Следовательно, мы идентифицировали 13 значимых SNP, связанных с длиной семени, и 8 с контролируемой шириной семени (см. Рисунок 6 и дополнительную таблицу S10). Примечательно, что ведущий SNP на хромосоме 3 (SNP3.16732086; -log 10 P = 13,95), влияющий на длину зрелого семени, соответствовал GS3 , известный регулятор размера семян (Fan et al., 2006). Это известное регулирование GS3 объясняло 13,24% фенотипической изменчивости (рисунок 6 и дополнительная таблица S8). GS3 кодирует субъединицу комплекса G-белка. Обсуждается, что различные аллели GS3 способствуют продвижению либо более длинных (нулевые аллели; Fan et al. , 2006; Takano-Kai et al., 2009), либо более коротких семян (аллель приобретения функции; Mao et al., 2010). ). Два других значимых SNP для длины зерна были обнаружены на хромосоме 4 (SNP4.4655556; -log 10 P = 5,66) и 6 (SNP6.1112028; -log 10 P = 5,99), которые включают деформированный внутренний орган цветка 1 и экспрессированный белок соответственно. Рисунок 6. Манхэттенские графики полногеномного ассоциативного анализа длины зрелого зерна (верхняя панель) и ширины (нижняя панель). Горизонтальная красная пунктирная линия указывает пороговое значение порога значимости ( P < 3,3 × 10 – 6 или -log 10 ( p ) > 5,4) уровень. Ранее известные основные регуляторы длины семян ( GS3 ) и ширины ( qSW5 ) выделены красной стрелкой. Кроме того, мы определили несколько SNP для ширины семян (см. Дополнительную таблицу S10). Например, ведущий SNP на хромосоме 2 (SNP2. 2487459; -log 10 P = 6,07) локализуется совместно с экспрессированным белком ( Os02g05199 ), а SNP на хромосоме 3 (SNP3.10130641; — журнал 10 P = 5,84) локализуется в межгенной последовательности между Os03g18130 и Os03g18140 (см. рисунок 6 и дополнительную таблицу S10). Интересно, что значимый SNP на хромосоме 5 (SNP5.5348012; -log 10 P = 5,56; см. рисунок 6 и дополнительную таблицу S10) соответствовал известному регулятору ширины семени, qSW5/GW5 (Weng et al. ., 2008; Дуан и др., 2017; Лю и др., 2017; Кумар и др., 2019). Этот SNP объяснил фенотипическую изменчивость в 4,4%, что согласуется с предыдущими исследованиями (Huang et al., 2010; Zhao et al., 2011). Обнаружение известных регуляторов размера семян и новых локусов из ассоциативного картирования морфометрических данных, полученных с помощью SeedExtractor , подтверждает возможности приложения для облегчения обнаружения признаков. Затем, чтобы проверить способность SeedExtractor извлекать колориметрические характеристики, мы проверили RDP1, которые уже были визуально классифицированы на основе цвета семян (Liakat Ali et al., 2011; Zhao et al., 2011; Eizenga et al., 2014). Мы обнаружили четкое различие между интенсивностью цвета, полученной с помощью SeedExtractor , которая соответствовала разным группам на основе цвета (см. Дополнительный рисунок S7 и Дополнительную таблицу S11). В совокупности эти результаты подтверждают надежность Возможность SeedExtractor анализировать параметры размера, формы и цвета семян, которые можно использовать в последующем генетическом анализе для выявления признаков. Это кросс-платформенное приложение с открытым исходным кодом предоставляет мощный инструмент для быстрого анализа изображений семян самых разных видов растений. Точность инструмента демонстрирует GWAS, который идентифицировал известные регуляторы длины и ширины семян риса. Универсальность этого инструмента может выходить за рамки планшетных сканированных изображений, поскольку он также может оценивать изображения, снятые другими камерами. В будущем этот инструмент может быть расширен для включения последующей обработки результатов (например, фенотипического распределения и кластеризации), а также для оценки других параметров, связанных с урожайностью, таких как непрозрачность или известковость риса, которые объясняют значительные потери урожая в глобальном масштабе. производство риса. Все наборы данных, созданные для этого исследования, включены в статью/дополнительный материал. Дальнейшие запросы можно направлять соответствующим авторам. HW и HY руководили проектом. PP руководил исследованием, сканировал семена и проводил измерения вручную. PP, BD, JS, LI и KW провели эксперимент на панели разнообразия риса 1. FZ спроектировал и разработал приложение. WH и GM провели анализ фенотипических данных и картирование ассоциаций всего генома. PP и HW выполнили анализ генов-кандидатов. ПП и ФЗ написали рукопись. Все авторы прочитали и одобрили рукопись. Эта работа была поддержана премией Национального научного фонда № 1736192 для HW, GM и HY. Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов. Эта рукопись была выпущена в качестве препринта в bioRxiv (Zhu et al., 2020). Мы хотели бы поблагодарить Мэнни Салуйя и Скотта Саттлера за семена сорго, Карлоса Урреа за семена фасоли обыкновенной, Явуза Делена и Исмаила Двайката за семена подсолнечника. Дополнительный материал к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2020.581546/full#supplementary-material Дополнительный рисунок 1 | Изображения, используемые для тестирования производительности. Дополнительный рисунок 2 | Параметры, используемые для оценки изображений нескольких видов растений. Дополнительный рисунок 3 | Параметры цвета и размера семян, используемые Пользователем-1 и Пользователем-2. Дополнительный рисунок 4 | Семена риса, развивающиеся через 7 и 10 дней после внесения удобрений, проанализированы с использованием SeedExtractor . Дополнительный рисунок 5 | Графическая резка. Дополнительный рисунок 6 | Фенотипическое распределение длины и ширины зрелых семян. Дополнительный рисунок 7 | Коробчатая диаграмма, представляющая интенсивность исходного цвета для трех каналов в цветовом пространстве RGB для визуально классифицированного RDP1. Цифры под цветовыми группами означают количество генотипов в соответствующей группе. Для статистики мы использовали LSmeans студента t — тест по всем 15 группам (5 цветовых групп и 3 цветовых канала). Разные буквы указывают на существенные различия между конкретной группой и каналом; α = 0,05 и t-статистика = 1,96. Дополнительная таблица 1 | Проверка производительности с добавочными начальными номерами. Дополнительная таблица 2 | Тестирование производительности с добавочным разрешением изображения. Дополнительная таблица 3 | Оценка эффективности по времени. Дополнительная таблица 4 | Ручное и автоматическое измерение длины семян. Дополнительная таблица 5 | Морфометрический анализ с использованием автоматизированных приложений. Дополнительная таблица 6 | SeedExtractor на основе анализа изображений семян различных растений. Дополнительная таблица 7 | Морфометрические измерения изображений зрелых семян различных видов растений с помощью SeedExtractor двумя дополнительными пользователями (Пользователь-1 и Пользователь-2). Также представлены параметры цвета и размера по Пользователям-1 и 2. Дополнительная таблица 8 | Изменение (площадь и цвет-1) изображений зрелых семян разных видов растений с помощью SeedExtractor двумя дополнительными пользователями (Пользователь-1 и Пользователь-2). Дополнительная таблица 9 | Образцы риса, использованные для полногеномного изучения ассоциаций. Дополнительная таблица 10 | Значимые SNP, связанные с длиной и шириной семени. Дополнительная таблица 11 | Начальная интенсивность цвета для трех каналов в цветовом пространстве RGB для RDP1. Дополнительный лист технических данных 1 | Руководство по SeedExtractor . Bai, X., Zhao, H., Huang, Y., Xie, W., Han, Z., Zhang, B., et al. (2016). Анализ ассоциации всего генома показывает различный генетический контроль в архитектуре метелки у риса Indica и Japonica. Геном растений 9, 1–10. doi: 10.3835/plantgenome2015.11.0115 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Брюс Дж., Балч Т. и Велозо М. (2000). «Быстрая и недорогая сегментация цветных изображений для интерактивных роботов», в Материалы Международной конференции IEEE по интеллектуальным роботам и системам (Такамацу: IEEE), 2061–2066. doi: 10.1109/iros.2000.895274 Полный текст CrossRef | Google Scholar Касас М.И., Дуарте С., Досефф А.И. и Гротевольд Э. (2014). Кукуруза, богатая флавонами: возможность повысить питательную ценность важной товарной культуры. Перед. Растениевод. 5:440. doi: 10.3389/fpls.2014.00440 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google Дхатт, Б.К., Эбшир, Н., Пол, П., Хасантика, К., Сандху, Дж., Чжан, К., и др. (2019). Метаболическая динамика развивающихся семян риса в условиях ночного температурного стресса. Перед. Растениевод. 10:1443. doi: 10.3389/FPLS.2019.01443 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Дуань П., Сюй Дж., Цзэн Д., Чжан Б., Гэн М., Чжан Г. и др. (2017). Естественная изменчивость промотора GSE5 способствует разнообразию размеров зерен риса. Мол. Завод. 10, 685–694. doi: 10.1016/j.molp.2017.03.009 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Эйзенга, Г. К., Али, М. Л., Брайант, Р. Дж., Йетер, К. М., МакКлунг, А. М., и Маккауч, С. Р. (2014). Регистрация панели разнообразия риса 1 для полногеномных ассоциативных исследований. J. Реестр растений. 8, 109–116. doi: 10.3198/jpr2013.03.0013crmp Полный текст CrossRef | Google Scholar Эндельман, Дж. Б. (2011). Ридж-регрессия и другие ядра для геномной селекции с пакетом R rrBLUP. Геном растений J. 4:250. doi: 10.3835/plantgenome2011.08.0024 Полный текст CrossRef | Google Scholar Фальгрен Н., Гехан М. А. и Бакстер И. (2015). Свет, камера, действие: высокопроизводительное фенотипирование растений готово для крупного плана. Курс. мнение биол. растений 24, 93–99. doi: 10.1016/J.PBI.2015.02.006 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Fan, C., Xing, Y., Mao, H., Lu, T., Han, B., Xu, C., et al. (2006). GS3, основной QTL для длины и веса зерна и минорный QTL для ширины и толщины зерна в рисе, кодирует предполагаемый трансмембранный белок. Теор. заявл. Жене. 112, 1164–1171. doi: 10.1007/s00122-006-0218-211 CrossRef Full Text | Google Scholar Finocchiaro, F., Ferrari, B., Gianinetti, A., Dall’Asta, C., Galaverna, G., Scazzina, F., et al. (2007). Характеристика антиоксидантных соединений красного и белого риса и изменения общей антиоксидантной способности в процессе обработки. Мол. Нутр. Еда Рез. 51, 1006–1019. doi: 10.1002/mnfr.200700011 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google Фиорани, Ф., и Шурр, У. (2013). Будущие сценарии фенотипирования растений. Год. Преподобный завод биол. 64, 267–291. doi: 10.1146/annurev-arplant-050312-120137 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Фурбанк, Р. Т., и Тестер, М. (2011). Феномика — технологии для устранения узкого места фенотипирования. Trends Plant Sci. 16, 635–644. doi: 10.1016/j.tplants.2011.09.005 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Академия Google Gehan, M. A., Fahlgren, N., Abbasi, A., Berry, J.C., Callen, S.T., Chavez, L., et al. (2017). PlantCV v2: программное обеспечение для анализа изображений для высокопроизводительного фенотипирования растений. PeerJ 5:e4088. doi: 10.7717/peerj.4088 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Groos, C., Gay, G., Perretant, M.R., Gervais, L., Bernard, M., Dedryver, F., et al. (2002). Изучение взаимосвязи между предуборочной всхожестью и окраской зерна методом анализа локусов количественных признаков в скрещивании бело-краснозерных хлебных сортов с пшеницей. Теор. заявл. Жене. 104, 39–47. doi: 10.1007/s001220200004 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Хуанг X., Вэй X., Сан Т., Чжао К., Фэн К., Чжао Ю. и др. (2010). Полногеномные ассоциативные исследования 14 агрономических признаков местных сортов риса. Нац. Жене. 42, 961–967. doi: 10.1038/ng.695 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Кумар А. , Кумар С., Прасад М. и Такур Дж. К. (2019). Разработка мини-ядра, эффективно представляющего 3004 различных образца риса. bioRxiv [препринт] doi: 10.1101/762070 CrossRef Full Text | Google Scholar Кватра В., Шодль А., Эсса И., Терк Г. и Бобик А. (2003). Текстуры Graphcut: синтез изображений и видео с помощью графических нарезок. ACM Trans. График 22, 277–286. doi: 10.1145/882262.882264 Полный текст CrossRef | Google Scholar Лиакат Али, М., МакКлунг, А. М., Джиа, М. Х., Кимбалл, Дж. А., Маккауч, С. Р., и Джорджия, К. Э. (2011). Группа по разнообразию риса оценивала генетическое и агроморфологическое разнообразие между субпопуляциями и его географическое распространение. Растениеводство. 51:2021. doi: 10.2135/cropsci2010.11.0641 Полный текст CrossRef | Google Scholar Линг В., Ченг К., Ма Дж. и Ван Т. (2001). Красный и черный рис уменьшают образование атеросклеротических бляшек и повышают антиоксидантный статус у кроликов. Дж. Нутр. 131, 1421–1426. doi: 10.1093/jn/131.5.1421 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Liu, J., Chen, J., Zheng, X., Wu, F., Lin, Q., Heng, Y., et al. (2017). GW5 действует на сигнальном пути брассиностероидов, регулируя ширину и вес зерна риса. Природные растения 3:17043. doi: 10.1038/nplants.2017.43 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Мао Х., Сунь С., Яо Дж., Ван С., Ю С., Сюй С. и др. (2010). Связывание дифференциальных доменных функций белка GS3 с естественным изменением размера зерна риса. Проц. Натл. акад. науч. США 107, 19579–19584. doi: 10.1073/pnas.1014419107 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar McCouch, S.R., Wright, M.H., Tung, C.W., Maron, L.G., McNally, K.L., Fitzgerald, M., et al. (2016). Ресурсы открытого доступа для полногеномного картирования ассоциаций риса. Нац. коммун. 7:10532. doi: 10. 1038/ncomms10532 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Мур, С. Р., Гронуолл, Д. С., Миллер, Н. Д., и Сполдинг, Е. П. (2013). Картирование локусов количественных признаков, влияющих на особенности морфологии семян Arabidopsis thaliana, полученные компьютерным путем из изображений. Гены G3 Геномы Генет. 3, 109–118. doi: 10.1534/g3.112.003806 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Пол П., Дхатт Б.К., Сандху Дж., Хуссейн В., Ирвин Л., Морота Г. и др. (2020). Дивергентный фенотипический ответ образцов риса на кратковременный тепловой стресс во время раннего развития семян. Прямой завод 4, 1–13. doi: 10.1002/pld3.196 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Петрони К., Пилу Р. и Тонелли К. (2014). Антоцианы в кукурузе: богатство генов для здоровья человека. Планта 240, 901–911. doi: 10.1007/s00425-014-2131-2131 Полный текст CrossRef | Google Scholar R Core Team (2019). R: Язык и среда для статистических вычислений R Foundation для статистических вычислений. Вена: R Core Team. Google Scholar Sandhu, J., Zhu, F., Paul, P., Gao, T., Dhatt, B.K., Ge, Y., et al. (2019). PI-Plat: метод трехмерной реконструкции на основе изображений с высоким разрешением для оценки динамики роста признаков соцветий риса. Растительные методы 15:162. doi: 10.1186/s13007-019-0545-542 CrossRef Full Text | Google Scholar Шао Ю., Цзинь Л., Чжан Г., Лу Ю., Шен Ю. и Бао Дж. (2011). Ассоциативное картирование цвета зерна, содержания фенолов, содержания флавоноидов и антиоксидантной способности в лущеном рисе. Теория заявл. Жене. 122, 1005–1016. doi: 10.1007/s00122-010-1505-1504 Полный текст CrossRef | Google Scholar Такано-Кай Н., Хуэй Дж., Кубо Т., Суини М., Мацумото Т., Канамори Х. и др. (2009). Эволюционная история GS3, гена, определяющего длину зерна риса. Генетика 182, 1323–1334. doi: 10.1534/genetics. 109.103002 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Танабата Т., Шибая Т., Хори К., Эбана К. и Яно М. (2012). SmartGrain: высокопроизводительное программное обеспечение для фенотипирования для измерения формы семян с помощью анализа изображений. Физиол растений. 160, 1871–1880 гг. doi: 10.1104/pp.112.205120 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Тернер, С. Д. (2014). qqman: пакет R для визуализации результатов GWAS с использованием графиков QQ и Манхэттена. bioRxiv [препринт] doi: 10.1101/005165 CrossRef Полный текст | Google Scholar Венг Дж., Гу С., Ван X., Гао Х., Го Т., Су Н. и др. (2008). Выделение и начальная характеристика GW5, основного QTL, связанного с шириной и весом зерна риса. Сотовые Res. 18, 1199–1209. doi: 10.1038/cr.2008.307 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Whan, A.P., Smith, A.B., Cavanagh, C. R., Ral, J.P.F., Shaw, L.M., Howitt, C.A., et al. (2014). GrainScan: недорогой и быстрый метод измерения размера зерна и цвета. Растительные методы 10:23. doi: 10.1186/1746-4811-10-23 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Ян В., Фэн Х., Чжан X., Чжан Дж. и Дунан Дж. (2020). Феномика сельскохозяйственных культур и высокопроизводительное фенотипирование: прошлые десятилетия, текущие проблемы и перспективы на будущее. Мол. Завод 13, 187–214. doi: 10.1016/j.molp.2020.01.008 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Чжао К., Тунг К.-В., Эйзенга Г.К., Райт М.Х., Лиакат Али М., Прайс А.Х. и др. (2011). Полногеномное картирование ассоциации показывает богатую генетическую архитектуру сложных признаков у Oryza sativa . Нац. коммун. 2:467. doi: 10.1038/ncomms1467 PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar Чжао М., Линь Ю. и Чен Х. Тестирование производительности
Сравнение с другими автоматическими методами и ручными измерениями
Анализ семян других видов растений
Панель разнообразия риса 1: Тестовый пример для
SeedExtractor Валидация Морфометрические измерения
Полногеномное исследование ассоциации (GWAS)
Результаты и обсуждение
Тест производительности
Анализ изображений семян других видов
Валидация
SeedExtractor Полученные морфометрические и колориметрические данные Заключение
Заявление о доступности данных
Вклад автора
Финансирование
Конфликт интересов
Благодарности
Дополнительный материал
Ссылки